Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVF4

Helb, DNA helicase B, mousemouse

Predictions only

Length 1,074 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HelbQ6NVF4 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HelbQ6NVF4 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HelbQ6NVF4 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HelbQ6NVF4 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HelbQ6NVF4 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HelbQ6NVF4 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HelbQ6NVF4 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HelbQ6NVF4 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HelbQ6NVF4 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HelbQ6NVF4 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HelbQ6NVF4 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HelbQ6NVF4 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HelbQ6NVF4 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HelbQ6NVF4 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
HelbQ6NVF4 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
HelbQ6NVF4 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HelbQ6NVF4 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HelbQ6NVF4 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HelbQ6NVF4 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HelbQ6NVF4 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HelbQ6NVF4 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HelbQ6NVF4 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HelbQ6NVF4 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HelbQ6NVF4 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HelbQ6NVF4 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
HelbQ6NVF4 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HelbQ6NVF4 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HelbQ6NVF4 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HelbQ6NVF4 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HelbQ6NVF4 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HelbQ6NVF4 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HelbQ6NVF4 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HelbQ6NVF4 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HelbQ6NVF4 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HelbQ6NVF4 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HelbQ6NVF4 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HelbQ6NVF4 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HelbQ6NVF4 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HelbQ6NVF4 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HelbQ6NVF4 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HelbQ6NVF4 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HelbQ6NVF4 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HelbQ6NVF4 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HelbQ6NVF4 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HelbQ6NVF4 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HelbQ6NVF4 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HelbQ6NVF4 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HelbQ6NVF4 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HelbQ6NVF4 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HelbQ6NVF4 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HelbQ6NVF4 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HelbQ6NVF4 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HelbQ6NVF4 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HelbQ6NVF4 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HelbQ6NVF4 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HelbQ6NVF4 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HelbQ6NVF4 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
HelbQ6NVF4 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HelbQ6NVF4 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
HelbQ6NVF4 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
HelbQ6NVF4 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
HelbQ6NVF4 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
HelbQ6NVF4 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
HelbQ6NVF4 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
HelbQ6NVF4 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
HelbQ6NVF4 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HelbQ6NVF4 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
HelbQ6NVF4 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HelbQ6NVF4 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HelbQ6NVF4 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HelbQ6NVF4 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HelbQ6NVF4 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HelbQ6NVF4 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HelbQ6NVF4 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HelbQ6NVF4 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HelbQ6NVF4 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HelbQ6NVF4 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HelbQ6NVF4 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HelbQ6NVF4 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HelbQ6NVF4 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HelbQ6NVF4 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HelbQ6NVF4 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HelbQ6NVF4 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HelbQ6NVF4 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HelbQ6NVF4 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HelbQ6NVF4 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HelbQ6NVF4 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HelbQ6NVF4 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HelbQ6NVF4 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HelbQ6NVF4 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HelbQ6NVF4 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HelbQ6NVF4 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HelbQ6NVF4 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HelbQ6NVF4 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HelbQ6NVF4 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HelbQ6NVF4 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HelbQ6NVF4 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HelbQ6NVF4 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HelbQ6NVF4 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HelbQ6NVF4 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms