Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS46

Pdcd11, Protein RRP5 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd11Q6NS46 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Pdcd11Q6NS46 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Pdcd11Q6NS46 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Pdcd11Q6NS46 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Pdcd11Q6NS46 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Pdcd11Q6NS46 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Pdcd11Q6NS46 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Pdcd11Q6NS46 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Pdcd11Q6NS46 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Pdcd11Q6NS46 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Pdcd11Q6NS46 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Pdcd11Q6NS46 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Pdcd11Q6NS46 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pdcd11Q6NS46 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pdcd11Q6NS46 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pdcd11Q6NS46 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pdcd11Q6NS46 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pdcd11Q6NS46 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pdcd11Q6NS46 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pdcd11Q6NS46 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pdcd11Q6NS46 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pdcd11Q6NS46 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pdcd11Q6NS46 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Pdcd11Q6NS46 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Pdcd11Q6NS46 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Pdcd11Q6NS46 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Pdcd11Q6NS46 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Pdcd11Q6NS46 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Pdcd11Q6NS46 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Pdcd11Q6NS46 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Pdcd11Q6NS46 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pdcd11Q6NS46 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pdcd11Q6NS46 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pdcd11Q6NS46 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pdcd11Q6NS46 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pdcd11Q6NS46 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pdcd11Q6NS46 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pdcd11Q6NS46 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pdcd11Q6NS46 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pdcd11Q6NS46 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pdcd11Q6NS46 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pdcd11Q6NS46 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pdcd11Q6NS46 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pdcd11Q6NS46 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pdcd11Q6NS46 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pdcd11Q6NS46 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pdcd11Q6NS46 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pdcd11Q6NS46 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pdcd11Q6NS46 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pdcd11Q6NS46 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pdcd11Q6NS46 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pdcd11Q6NS46 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pdcd11Q6NS46 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pdcd11Q6NS46 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pdcd11Q6NS46 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pdcd11Q6NS46 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pdcd11Q6NS46 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pdcd11Q6NS46 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pdcd11Q6NS46 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pdcd11Q6NS46 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Pdcd11Q6NS46 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Pdcd11Q6NS46 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pdcd11Q6NS46 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pdcd11Q6NS46 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pdcd11Q6NS46 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pdcd11Q6NS46 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pdcd11Q6NS46 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pdcd11Q6NS46 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pdcd11Q6NS46 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pdcd11Q6NS46 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pdcd11Q6NS46 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pdcd11Q6NS46 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pdcd11Q6NS46 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pdcd11Q6NS46 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pdcd11Q6NS46 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Pdcd11Q6NS46 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pdcd11Q6NS46 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pdcd11Q6NS46 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pdcd11Q6NS46 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Pdcd11Q6NS46 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pdcd11Q6NS46 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pdcd11Q6NS46 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pdcd11Q6NS46 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pdcd11Q6NS46 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pdcd11Q6NS46 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pdcd11Q6NS46 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Pdcd11Q6NS46 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pdcd11Q6NS46 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pdcd11Q6NS46 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pdcd11Q6NS46 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pdcd11Q6NS46 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pdcd11Q6NS46 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pdcd11Q6NS46 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Pdcd11Q6NS46 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pdcd11Q6NS46 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pdcd11Q6NS46 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pdcd11Q6NS46 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pdcd11Q6NS46 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pdcd11Q6NS46 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pdcd11Q6NS46 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69 ms