Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS45

Ccdc66, Coiled-coil domain-containing protein 66, mousemouse

Predictions only

Length 935 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc66Q6NS45 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc66Q6NS45 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc66Q6NS45 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc66Q6NS45 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc66Q6NS45 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc66Q6NS45 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc66Q6NS45 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc66Q6NS45 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc66Q6NS45 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc66Q6NS45 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc66Q6NS45 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc66Q6NS45 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc66Q6NS45 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc66Q6NS45 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc66Q6NS45 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc66Q6NS45 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc66Q6NS45 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc66Q6NS45 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc66Q6NS45 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc66Q6NS45 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc66Q6NS45 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc66Q6NS45 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc66Q6NS45 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc66Q6NS45 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc66Q6NS45 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc66Q6NS45 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc66Q6NS45 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc66Q6NS45 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc66Q6NS45 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc66Q6NS45 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc66Q6NS45 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc66Q6NS45 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc66Q6NS45 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc66Q6NS45 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc66Q6NS45 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc66Q6NS45 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc66Q6NS45 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc66Q6NS45 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc66Q6NS45 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc66Q6NS45 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc66Q6NS45 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc66Q6NS45 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc66Q6NS45 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc66Q6NS45 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc66Q6NS45 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc66Q6NS45 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc66Q6NS45 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc66Q6NS45 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc66Q6NS45 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc66Q6NS45 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc66Q6NS45 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc66Q6NS45 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc66Q6NS45 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc66Q6NS45 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc66Q6NS45 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc66Q6NS45 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc66Q6NS45 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc66Q6NS45 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc66Q6NS45 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc66Q6NS45 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc66Q6NS45 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc66Q6NS45 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc66Q6NS45 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc66Q6NS45 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc66Q6NS45 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc66Q6NS45 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc66Q6NS45 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc66Q6NS45 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc66Q6NS45 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc66Q6NS45 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc66Q6NS45 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc66Q6NS45 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc66Q6NS45 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc66Q6NS45 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc66Q6NS45 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc66Q6NS45 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc66Q6NS45 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc66Q6NS45 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc66Q6NS45 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc66Q6NS45 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc66Q6NS45 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc66Q6NS45 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc66Q6NS45 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc66Q6NS45 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc66Q6NS45 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc66Q6NS45 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc66Q6NS45 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc66Q6NS45 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc66Q6NS45 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc66Q6NS45 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc66Q6NS45 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc66Q6NS45 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc66Q6NS45 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc66Q6NS45 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc66Q6NS45 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc66Q6NS45 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc66Q6NS45 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc66Q6NS45 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc66Q6NS45 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc66Q6NS45 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms