Protein–RNA interactions for Protein: Q6KAU4

Mvb12b, Multivesicular body subunit 12B, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mvb12bQ6KAU4 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mvb12bQ6KAU4 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mvb12bQ6KAU4 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mvb12bQ6KAU4 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mvb12bQ6KAU4 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mvb12bQ6KAU4 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mvb12bQ6KAU4 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mvb12bQ6KAU4 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mvb12bQ6KAU4 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mvb12bQ6KAU4 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mvb12bQ6KAU4 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mvb12bQ6KAU4 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mvb12bQ6KAU4 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mvb12bQ6KAU4 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mvb12bQ6KAU4 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mvb12bQ6KAU4 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mvb12bQ6KAU4 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mvb12bQ6KAU4 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mvb12bQ6KAU4 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mvb12bQ6KAU4 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mvb12bQ6KAU4 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mvb12bQ6KAU4 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mvb12bQ6KAU4 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mvb12bQ6KAU4 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mvb12bQ6KAU4 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mvb12bQ6KAU4 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mvb12bQ6KAU4 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mvb12bQ6KAU4 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mvb12bQ6KAU4 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mvb12bQ6KAU4 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mvb12bQ6KAU4 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Mvb12bQ6KAU4 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mvb12bQ6KAU4 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mvb12bQ6KAU4 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mvb12bQ6KAU4 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mvb12bQ6KAU4 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mvb12bQ6KAU4 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mvb12bQ6KAU4 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mvb12bQ6KAU4 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mvb12bQ6KAU4 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mvb12bQ6KAU4 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mvb12bQ6KAU4 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mvb12bQ6KAU4 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mvb12bQ6KAU4 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Mvb12bQ6KAU4 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Mvb12bQ6KAU4 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Mvb12bQ6KAU4 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Mvb12bQ6KAU4 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mvb12bQ6KAU4 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mvb12bQ6KAU4 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mvb12bQ6KAU4 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mvb12bQ6KAU4 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mvb12bQ6KAU4 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mvb12bQ6KAU4 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mvb12bQ6KAU4 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mvb12bQ6KAU4 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mvb12bQ6KAU4 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mvb12bQ6KAU4 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mvb12bQ6KAU4 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mvb12bQ6KAU4 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mvb12bQ6KAU4 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mvb12bQ6KAU4 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mvb12bQ6KAU4 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mvb12bQ6KAU4 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mvb12bQ6KAU4 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mvb12bQ6KAU4 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mvb12bQ6KAU4 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mvb12bQ6KAU4 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mvb12bQ6KAU4 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mvb12bQ6KAU4 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mvb12bQ6KAU4 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mvb12bQ6KAU4 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mvb12bQ6KAU4 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mvb12bQ6KAU4 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mvb12bQ6KAU4 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Mvb12bQ6KAU4 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Mvb12bQ6KAU4 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Mvb12bQ6KAU4 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Mvb12bQ6KAU4 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Mvb12bQ6KAU4 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mvb12bQ6KAU4 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mvb12bQ6KAU4 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Mvb12bQ6KAU4 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Mvb12bQ6KAU4 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mvb12bQ6KAU4 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mvb12bQ6KAU4 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mvb12bQ6KAU4 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mvb12bQ6KAU4 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mvb12bQ6KAU4 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mvb12bQ6KAU4 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mvb12bQ6KAU4 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mvb12bQ6KAU4 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mvb12bQ6KAU4 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mvb12bQ6KAU4 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mvb12bQ6KAU4 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mvb12bQ6KAU4 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Mvb12bQ6KAU4 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mvb12bQ6KAU4 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mvb12bQ6KAU4 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mvb12bQ6KAU4 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms