Protein–RNA interactions for Protein: Q6GQX2

Nckap5l, Nck-associated protein 5-like, mousemouse

Predictions only

Length 1,323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nckap5lQ6GQX2 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nckap5lQ6GQX2 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nckap5lQ6GQX2 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nckap5lQ6GQX2 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nckap5lQ6GQX2 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nckap5lQ6GQX2 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nckap5lQ6GQX2 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nckap5lQ6GQX2 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nckap5lQ6GQX2 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nckap5lQ6GQX2 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nckap5lQ6GQX2 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Nckap5lQ6GQX2 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nckap5lQ6GQX2 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nckap5lQ6GQX2 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nckap5lQ6GQX2 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nckap5lQ6GQX2 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nckap5lQ6GQX2 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nckap5lQ6GQX2 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nckap5lQ6GQX2 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nckap5lQ6GQX2 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nckap5lQ6GQX2 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nckap5lQ6GQX2 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nckap5lQ6GQX2 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nckap5lQ6GQX2 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Nckap5lQ6GQX2 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nckap5lQ6GQX2 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nckap5lQ6GQX2 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Nckap5lQ6GQX2 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Nckap5lQ6GQX2 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Nckap5lQ6GQX2 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Nckap5lQ6GQX2 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Nckap5lQ6GQX2 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Nckap5lQ6GQX2 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nckap5lQ6GQX2 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nckap5lQ6GQX2 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nckap5lQ6GQX2 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nckap5lQ6GQX2 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nckap5lQ6GQX2 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nckap5lQ6GQX2 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nckap5lQ6GQX2 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nckap5lQ6GQX2 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nckap5lQ6GQX2 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nckap5lQ6GQX2 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nckap5lQ6GQX2 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nckap5lQ6GQX2 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nckap5lQ6GQX2 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nckap5lQ6GQX2 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nckap5lQ6GQX2 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nckap5lQ6GQX2 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nckap5lQ6GQX2 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nckap5lQ6GQX2 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nckap5lQ6GQX2 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nckap5lQ6GQX2 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nckap5lQ6GQX2 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nckap5lQ6GQX2 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nckap5lQ6GQX2 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nckap5lQ6GQX2 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nckap5lQ6GQX2 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nckap5lQ6GQX2 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Nckap5lQ6GQX2 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nckap5lQ6GQX2 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nckap5lQ6GQX2 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Nckap5lQ6GQX2 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nckap5lQ6GQX2 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nckap5lQ6GQX2 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nckap5lQ6GQX2 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nckap5lQ6GQX2 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nckap5lQ6GQX2 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Nckap5lQ6GQX2 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Nckap5lQ6GQX2 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nckap5lQ6GQX2 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nckap5lQ6GQX2 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nckap5lQ6GQX2 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nckap5lQ6GQX2 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nckap5lQ6GQX2 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nckap5lQ6GQX2 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nckap5lQ6GQX2 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nckap5lQ6GQX2 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nckap5lQ6GQX2 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nckap5lQ6GQX2 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nckap5lQ6GQX2 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nckap5lQ6GQX2 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Nckap5lQ6GQX2 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nckap5lQ6GQX2 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nckap5lQ6GQX2 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nckap5lQ6GQX2 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nckap5lQ6GQX2 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nckap5lQ6GQX2 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nckap5lQ6GQX2 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Nckap5lQ6GQX2 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nckap5lQ6GQX2 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nckap5lQ6GQX2 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nckap5lQ6GQX2 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nckap5lQ6GQX2 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nckap5lQ6GQX2 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nckap5lQ6GQX2 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nckap5lQ6GQX2 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nckap5lQ6GQX2 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Nckap5lQ6GQX2 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nckap5lQ6GQX2 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms