Protein–RNA interactions for Protein: Q6DID3

Scaf8, Protein SCAF8, mousemouse

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf8Q6DID3 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Scaf8Q6DID3 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Scaf8Q6DID3 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Scaf8Q6DID3 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Scaf8Q6DID3 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Scaf8Q6DID3 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Scaf8Q6DID3 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Scaf8Q6DID3 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Scaf8Q6DID3 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Scaf8Q6DID3 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Scaf8Q6DID3 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Scaf8Q6DID3 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Scaf8Q6DID3 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Scaf8Q6DID3 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Scaf8Q6DID3 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Scaf8Q6DID3 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Scaf8Q6DID3 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Scaf8Q6DID3 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Scaf8Q6DID3 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Scaf8Q6DID3 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Scaf8Q6DID3 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Scaf8Q6DID3 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Scaf8Q6DID3 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Scaf8Q6DID3 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
Scaf8Q6DID3 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Scaf8Q6DID3 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Scaf8Q6DID3 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Scaf8Q6DID3 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Scaf8Q6DID3 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Scaf8Q6DID3 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Scaf8Q6DID3 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Scaf8Q6DID3 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Scaf8Q6DID3 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Scaf8Q6DID3 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Scaf8Q6DID3 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Scaf8Q6DID3 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Scaf8Q6DID3 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Scaf8Q6DID3 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Scaf8Q6DID3 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Scaf8Q6DID3 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Scaf8Q6DID3 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Scaf8Q6DID3 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Scaf8Q6DID3 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Scaf8Q6DID3 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Scaf8Q6DID3 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Scaf8Q6DID3 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Scaf8Q6DID3 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Scaf8Q6DID3 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Scaf8Q6DID3 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Scaf8Q6DID3 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Scaf8Q6DID3 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Scaf8Q6DID3 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Scaf8Q6DID3 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Scaf8Q6DID3 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Scaf8Q6DID3 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Scaf8Q6DID3 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Scaf8Q6DID3 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Scaf8Q6DID3 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Scaf8Q6DID3 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Scaf8Q6DID3 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Scaf8Q6DID3 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Scaf8Q6DID3 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Scaf8Q6DID3 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Scaf8Q6DID3 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Scaf8Q6DID3 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Scaf8Q6DID3 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Scaf8Q6DID3 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Scaf8Q6DID3 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Scaf8Q6DID3 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Scaf8Q6DID3 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Scaf8Q6DID3 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Scaf8Q6DID3 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Scaf8Q6DID3 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Scaf8Q6DID3 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Scaf8Q6DID3 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Scaf8Q6DID3 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Scaf8Q6DID3 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Scaf8Q6DID3 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Scaf8Q6DID3 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Scaf8Q6DID3 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Scaf8Q6DID3 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Scaf8Q6DID3 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Scaf8Q6DID3 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Scaf8Q6DID3 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Scaf8Q6DID3 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Scaf8Q6DID3 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Scaf8Q6DID3 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Scaf8Q6DID3 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Scaf8Q6DID3 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Scaf8Q6DID3 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Scaf8Q6DID3 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Scaf8Q6DID3 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Scaf8Q6DID3 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Scaf8Q6DID3 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Scaf8Q6DID3 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Scaf8Q6DID3 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Scaf8Q6DID3 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Scaf8Q6DID3 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Scaf8Q6DID3 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Scaf8Q6DID3 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms