Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC6

Tro, Tro protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,087 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TroQ6DIC6 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
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TroQ6DIC6 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TroQ6DIC6 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TroQ6DIC6 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TroQ6DIC6 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TroQ6DIC6 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TroQ6DIC6 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TroQ6DIC6 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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TroQ6DIC6 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TroQ6DIC6 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TroQ6DIC6 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TroQ6DIC6 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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TroQ6DIC6 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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TroQ6DIC6 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
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TroQ6DIC6 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
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TroQ6DIC6 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
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TroQ6DIC6 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TroQ6DIC6 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TroQ6DIC6 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
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TroQ6DIC6 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TroQ6DIC6 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
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TroQ6DIC6 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TroQ6DIC6 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TroQ6DIC6 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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TroQ6DIC6 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TroQ6DIC6 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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TroQ6DIC6 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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TroQ6DIC6 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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TroQ6DIC6 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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TroQ6DIC6 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TroQ6DIC6 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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TroQ6DIC6 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TroQ6DIC6 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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TroQ6DIC6 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TroQ6DIC6 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TroQ6DIC6 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
TroQ6DIC6 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TroQ6DIC6 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TroQ6DIC6 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TroQ6DIC6 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TroQ6DIC6 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TroQ6DIC6 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TroQ6DIC6 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TroQ6DIC6 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TroQ6DIC6 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TroQ6DIC6 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TroQ6DIC6 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TroQ6DIC6 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TroQ6DIC6 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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