Protein–RNA interactions for Protein: Q6A0D4

Rftn1, Raftlin, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rftn1Q6A0D4 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rftn1Q6A0D4 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rftn1Q6A0D4 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rftn1Q6A0D4 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rftn1Q6A0D4 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rftn1Q6A0D4 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Rftn1Q6A0D4 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rftn1Q6A0D4 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rftn1Q6A0D4 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rftn1Q6A0D4 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Rftn1Q6A0D4 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rftn1Q6A0D4 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Rftn1Q6A0D4 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rftn1Q6A0D4 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rftn1Q6A0D4 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rftn1Q6A0D4 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rftn1Q6A0D4 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rftn1Q6A0D4 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rftn1Q6A0D4 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rftn1Q6A0D4 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rftn1Q6A0D4 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rftn1Q6A0D4 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rftn1Q6A0D4 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rftn1Q6A0D4 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rftn1Q6A0D4 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rftn1Q6A0D4 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rftn1Q6A0D4 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rftn1Q6A0D4 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rftn1Q6A0D4 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rftn1Q6A0D4 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rftn1Q6A0D4 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rftn1Q6A0D4 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rftn1Q6A0D4 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rftn1Q6A0D4 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rftn1Q6A0D4 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rftn1Q6A0D4 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rftn1Q6A0D4 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rftn1Q6A0D4 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rftn1Q6A0D4 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rftn1Q6A0D4 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rftn1Q6A0D4 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rftn1Q6A0D4 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rftn1Q6A0D4 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Rftn1Q6A0D4 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rftn1Q6A0D4 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rftn1Q6A0D4 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rftn1Q6A0D4 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rftn1Q6A0D4 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rftn1Q6A0D4 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rftn1Q6A0D4 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rftn1Q6A0D4 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rftn1Q6A0D4 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rftn1Q6A0D4 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rftn1Q6A0D4 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rftn1Q6A0D4 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rftn1Q6A0D4 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rftn1Q6A0D4 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rftn1Q6A0D4 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Rftn1Q6A0D4 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Rftn1Q6A0D4 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rftn1Q6A0D4 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Rftn1Q6A0D4 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rftn1Q6A0D4 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rftn1Q6A0D4 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rftn1Q6A0D4 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rftn1Q6A0D4 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rftn1Q6A0D4 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rftn1Q6A0D4 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rftn1Q6A0D4 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rftn1Q6A0D4 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rftn1Q6A0D4 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rftn1Q6A0D4 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Rftn1Q6A0D4 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Rftn1Q6A0D4 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rftn1Q6A0D4 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rftn1Q6A0D4 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rftn1Q6A0D4 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rftn1Q6A0D4 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rftn1Q6A0D4 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rftn1Q6A0D4 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rftn1Q6A0D4 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rftn1Q6A0D4 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rftn1Q6A0D4 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rftn1Q6A0D4 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rftn1Q6A0D4 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rftn1Q6A0D4 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rftn1Q6A0D4 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rftn1Q6A0D4 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rftn1Q6A0D4 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rftn1Q6A0D4 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rftn1Q6A0D4 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rftn1Q6A0D4 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rftn1Q6A0D4 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Rftn1Q6A0D4 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Rftn1Q6A0D4 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rftn1Q6A0D4 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rftn1Q6A0D4 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rftn1Q6A0D4 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rftn1Q6A0D4 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rftn1Q6A0D4 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.4 ms