Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pkp4Q68FH0 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pkp4Q68FH0 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pkp4Q68FH0 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pkp4Q68FH0 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pkp4Q68FH0 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pkp4Q68FH0 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pkp4Q68FH0 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pkp4Q68FH0 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pkp4Q68FH0 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Pkp4Q68FH0 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Pkp4Q68FH0 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pkp4Q68FH0 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pkp4Q68FH0 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pkp4Q68FH0 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pkp4Q68FH0 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pkp4Q68FH0 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pkp4Q68FH0 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pkp4Q68FH0 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pkp4Q68FH0 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pkp4Q68FH0 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pkp4Q68FH0 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pkp4Q68FH0 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pkp4Q68FH0 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pkp4Q68FH0 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pkp4Q68FH0 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pkp4Q68FH0 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pkp4Q68FH0 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pkp4Q68FH0 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pkp4Q68FH0 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Pkp4Q68FH0 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pkp4Q68FH0 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pkp4Q68FH0 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pkp4Q68FH0 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pkp4Q68FH0 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pkp4Q68FH0 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pkp4Q68FH0 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pkp4Q68FH0 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pkp4Q68FH0 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pkp4Q68FH0 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pkp4Q68FH0 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pkp4Q68FH0 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pkp4Q68FH0 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pkp4Q68FH0 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pkp4Q68FH0 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pkp4Q68FH0 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pkp4Q68FH0 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pkp4Q68FH0 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pkp4Q68FH0 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pkp4Q68FH0 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pkp4Q68FH0 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pkp4Q68FH0 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pkp4Q68FH0 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pkp4Q68FH0 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pkp4Q68FH0 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pkp4Q68FH0 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pkp4Q68FH0 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pkp4Q68FH0 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Pkp4Q68FH0 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pkp4Q68FH0 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pkp4Q68FH0 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Pkp4Q68FH0 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pkp4Q68FH0 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pkp4Q68FH0 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pkp4Q68FH0 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pkp4Q68FH0 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pkp4Q68FH0 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pkp4Q68FH0 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pkp4Q68FH0 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pkp4Q68FH0 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pkp4Q68FH0 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pkp4Q68FH0 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pkp4Q68FH0 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pkp4Q68FH0 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pkp4Q68FH0 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pkp4Q68FH0 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pkp4Q68FH0 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Pkp4Q68FH0 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pkp4Q68FH0 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pkp4Q68FH0 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pkp4Q68FH0 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pkp4Q68FH0 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pkp4Q68FH0 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pkp4Q68FH0 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Pkp4Q68FH0 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pkp4Q68FH0 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pkp4Q68FH0 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pkp4Q68FH0 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pkp4Q68FH0 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pkp4Q68FH0 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pkp4Q68FH0 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pkp4Q68FH0 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pkp4Q68FH0 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pkp4Q68FH0 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pkp4Q68FH0 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pkp4Q68FH0 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pkp4Q68FH0 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pkp4Q68FH0 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pkp4Q68FH0 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Pkp4Q68FH0 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.5 ms