Protein–RNA interactions for Protein: Q68EF0

Rab3ip, Rab-3A-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3ipQ68EF0 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Rab3ipQ68EF0 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rab3ipQ68EF0 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rab3ipQ68EF0 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rab3ipQ68EF0 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rab3ipQ68EF0 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rab3ipQ68EF0 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rab3ipQ68EF0 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rab3ipQ68EF0 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab3ipQ68EF0 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab3ipQ68EF0 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab3ipQ68EF0 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab3ipQ68EF0 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab3ipQ68EF0 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab3ipQ68EF0 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab3ipQ68EF0 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab3ipQ68EF0 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab3ipQ68EF0 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab3ipQ68EF0 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab3ipQ68EF0 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab3ipQ68EF0 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab3ipQ68EF0 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab3ipQ68EF0 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab3ipQ68EF0 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab3ipQ68EF0 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab3ipQ68EF0 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab3ipQ68EF0 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab3ipQ68EF0 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab3ipQ68EF0 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab3ipQ68EF0 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab3ipQ68EF0 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab3ipQ68EF0 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab3ipQ68EF0 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab3ipQ68EF0 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab3ipQ68EF0 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab3ipQ68EF0 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab3ipQ68EF0 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab3ipQ68EF0 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab3ipQ68EF0 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab3ipQ68EF0 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab3ipQ68EF0 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab3ipQ68EF0 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab3ipQ68EF0 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab3ipQ68EF0 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab3ipQ68EF0 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab3ipQ68EF0 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab3ipQ68EF0 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab3ipQ68EF0 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab3ipQ68EF0 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab3ipQ68EF0 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab3ipQ68EF0 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab3ipQ68EF0 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab3ipQ68EF0 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab3ipQ68EF0 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab3ipQ68EF0 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab3ipQ68EF0 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab3ipQ68EF0 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab3ipQ68EF0 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab3ipQ68EF0 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab3ipQ68EF0 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab3ipQ68EF0 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab3ipQ68EF0 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab3ipQ68EF0 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab3ipQ68EF0 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab3ipQ68EF0 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab3ipQ68EF0 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab3ipQ68EF0 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab3ipQ68EF0 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab3ipQ68EF0 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab3ipQ68EF0 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab3ipQ68EF0 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab3ipQ68EF0 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab3ipQ68EF0 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab3ipQ68EF0 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab3ipQ68EF0 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab3ipQ68EF0 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab3ipQ68EF0 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab3ipQ68EF0 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab3ipQ68EF0 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab3ipQ68EF0 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab3ipQ68EF0 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab3ipQ68EF0 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab3ipQ68EF0 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab3ipQ68EF0 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab3ipQ68EF0 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab3ipQ68EF0 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab3ipQ68EF0 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab3ipQ68EF0 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab3ipQ68EF0 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab3ipQ68EF0 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab3ipQ68EF0 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab3ipQ68EF0 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab3ipQ68EF0 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab3ipQ68EF0 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab3ipQ68EF0 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab3ipQ68EF0 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab3ipQ68EF0 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab3ipQ68EF0 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab3ipQ68EF0 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab3ipQ68EF0 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms