Protein–RNA interactions for Protein: Q64727

Vcl, Vinculin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VclQ64727 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VclQ64727 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VclQ64727 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VclQ64727 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VclQ64727 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VclQ64727 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VclQ64727 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VclQ64727 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VclQ64727 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VclQ64727 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VclQ64727 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VclQ64727 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VclQ64727 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VclQ64727 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VclQ64727 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
VclQ64727 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VclQ64727 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VclQ64727 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VclQ64727 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
VclQ64727 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VclQ64727 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VclQ64727 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
VclQ64727 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
VclQ64727 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
VclQ64727 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
VclQ64727 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
VclQ64727 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
VclQ64727 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
VclQ64727 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
VclQ64727 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
VclQ64727 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
VclQ64727 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
VclQ64727 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
VclQ64727 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
VclQ64727 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
VclQ64727 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
VclQ64727 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
VclQ64727 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
VclQ64727 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
VclQ64727 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
VclQ64727 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
VclQ64727 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VclQ64727 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
VclQ64727 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VclQ64727 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VclQ64727 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VclQ64727 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
VclQ64727 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VclQ64727 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VclQ64727 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VclQ64727 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
VclQ64727 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VclQ64727 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VclQ64727 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VclQ64727 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VclQ64727 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VclQ64727 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
VclQ64727 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VclQ64727 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VclQ64727 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VclQ64727 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VclQ64727 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VclQ64727 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VclQ64727 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VclQ64727 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VclQ64727 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VclQ64727 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VclQ64727 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VclQ64727 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VclQ64727 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VclQ64727 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VclQ64727 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
VclQ64727 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
VclQ64727 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
VclQ64727 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VclQ64727 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
VclQ64727 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VclQ64727 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
VclQ64727 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
VclQ64727 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VclQ64727 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VclQ64727 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VclQ64727 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VclQ64727 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
VclQ64727 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VclQ64727 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VclQ64727 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VclQ64727 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
VclQ64727 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VclQ64727 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
VclQ64727 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VclQ64727 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
VclQ64727 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VclQ64727 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VclQ64727 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VclQ64727 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
VclQ64727 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VclQ64727 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VclQ64727 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VclQ64727 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms