Protein–RNA interactions for Protein: Q64310

Surf4, Surfeit locus protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf4Q64310 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Surf4Q64310 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Surf4Q64310 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Surf4Q64310 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Surf4Q64310 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Surf4Q64310 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Surf4Q64310 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Surf4Q64310 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Surf4Q64310 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Surf4Q64310 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Surf4Q64310 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Surf4Q64310 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Surf4Q64310 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Surf4Q64310 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Surf4Q64310 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Surf4Q64310 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Surf4Q64310 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Surf4Q64310 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Surf4Q64310 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Surf4Q64310 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Surf4Q64310 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Surf4Q64310 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Surf4Q64310 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Surf4Q64310 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Surf4Q64310 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Surf4Q64310 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Surf4Q64310 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Surf4Q64310 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Surf4Q64310 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Surf4Q64310 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Surf4Q64310 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Surf4Q64310 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Surf4Q64310 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Surf4Q64310 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Surf4Q64310 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Surf4Q64310 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Surf4Q64310 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Surf4Q64310 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Surf4Q64310 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Surf4Q64310 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Surf4Q64310 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Surf4Q64310 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Surf4Q64310 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Surf4Q64310 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Surf4Q64310 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Surf4Q64310 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Surf4Q64310 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Surf4Q64310 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Surf4Q64310 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Surf4Q64310 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Surf4Q64310 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Surf4Q64310 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Surf4Q64310 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Surf4Q64310 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Surf4Q64310 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Surf4Q64310 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Surf4Q64310 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Surf4Q64310 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Surf4Q64310 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Surf4Q64310 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Surf4Q64310 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Surf4Q64310 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Surf4Q64310 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Surf4Q64310 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Surf4Q64310 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Surf4Q64310 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Surf4Q64310 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Surf4Q64310 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Surf4Q64310 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Surf4Q64310 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Surf4Q64310 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Surf4Q64310 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Surf4Q64310 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Surf4Q64310 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Surf4Q64310 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Surf4Q64310 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Surf4Q64310 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Surf4Q64310 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Surf4Q64310 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Surf4Q64310 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Surf4Q64310 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Surf4Q64310 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Surf4Q64310 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Surf4Q64310 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Surf4Q64310 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Surf4Q64310 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Surf4Q64310 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Surf4Q64310 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Surf4Q64310 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Surf4Q64310 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Surf4Q64310 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Surf4Q64310 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Surf4Q64310 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Surf4Q64310 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Surf4Q64310 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Surf4Q64310 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Surf4Q64310 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Surf4Q64310 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Surf4Q64310 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Surf4Q64310 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms