Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW7

Patj, InaD-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PatjQ63ZW7 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PatjQ63ZW7 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PatjQ63ZW7 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PatjQ63ZW7 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PatjQ63ZW7 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PatjQ63ZW7 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PatjQ63ZW7 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PatjQ63ZW7 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PatjQ63ZW7 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PatjQ63ZW7 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PatjQ63ZW7 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PatjQ63ZW7 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PatjQ63ZW7 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PatjQ63ZW7 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PatjQ63ZW7 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PatjQ63ZW7 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PatjQ63ZW7 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PatjQ63ZW7 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PatjQ63ZW7 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PatjQ63ZW7 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PatjQ63ZW7 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PatjQ63ZW7 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PatjQ63ZW7 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PatjQ63ZW7 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PatjQ63ZW7 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PatjQ63ZW7 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PatjQ63ZW7 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PatjQ63ZW7 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PatjQ63ZW7 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PatjQ63ZW7 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PatjQ63ZW7 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
PatjQ63ZW7 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PatjQ63ZW7 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PatjQ63ZW7 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PatjQ63ZW7 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PatjQ63ZW7 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PatjQ63ZW7 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PatjQ63ZW7 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PatjQ63ZW7 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PatjQ63ZW7 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PatjQ63ZW7 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PatjQ63ZW7 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PatjQ63ZW7 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PatjQ63ZW7 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PatjQ63ZW7 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PatjQ63ZW7 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PatjQ63ZW7 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PatjQ63ZW7 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.71
PatjQ63ZW7 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PatjQ63ZW7 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PatjQ63ZW7 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PatjQ63ZW7 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PatjQ63ZW7 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PatjQ63ZW7 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PatjQ63ZW7 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PatjQ63ZW7 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PatjQ63ZW7 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PatjQ63ZW7 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PatjQ63ZW7 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PatjQ63ZW7 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PatjQ63ZW7 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PatjQ63ZW7 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PatjQ63ZW7 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PatjQ63ZW7 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PatjQ63ZW7 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PatjQ63ZW7 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PatjQ63ZW7 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PatjQ63ZW7 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PatjQ63ZW7 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PatjQ63ZW7 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PatjQ63ZW7 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PatjQ63ZW7 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PatjQ63ZW7 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PatjQ63ZW7 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PatjQ63ZW7 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PatjQ63ZW7 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PatjQ63ZW7 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PatjQ63ZW7 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PatjQ63ZW7 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PatjQ63ZW7 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PatjQ63ZW7 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PatjQ63ZW7 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PatjQ63ZW7 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PatjQ63ZW7 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PatjQ63ZW7 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PatjQ63ZW7 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PatjQ63ZW7 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PatjQ63ZW7 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PatjQ63ZW7 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PatjQ63ZW7 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PatjQ63ZW7 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PatjQ63ZW7 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PatjQ63ZW7 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PatjQ63ZW7 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PatjQ63ZW7 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PatjQ63ZW7 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PatjQ63ZW7 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PatjQ63ZW7 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
PatjQ63ZW7 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PatjQ63ZW7 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms