Protein–RNA interactions for Protein: Q62559

Ift52, Intraflagellar transport protein 52 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift52Q62559 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ift52Q62559 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ift52Q62559 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ift52Q62559 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ift52Q62559 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ift52Q62559 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ift52Q62559 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ift52Q62559 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ift52Q62559 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ift52Q62559 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ift52Q62559 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ift52Q62559 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ift52Q62559 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ift52Q62559 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ift52Q62559 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ift52Q62559 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ift52Q62559 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ift52Q62559 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ift52Q62559 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ift52Q62559 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ift52Q62559 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ift52Q62559 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ift52Q62559 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ift52Q62559 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ift52Q62559 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ift52Q62559 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ift52Q62559 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ift52Q62559 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ift52Q62559 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ift52Q62559 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ift52Q62559 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ift52Q62559 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ift52Q62559 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ift52Q62559 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ift52Q62559 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ift52Q62559 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ift52Q62559 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ift52Q62559 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ift52Q62559 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ift52Q62559 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ift52Q62559 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ift52Q62559 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ift52Q62559 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ift52Q62559 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ift52Q62559 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ift52Q62559 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ift52Q62559 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ift52Q62559 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ift52Q62559 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ift52Q62559 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ift52Q62559 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ift52Q62559 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ift52Q62559 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ift52Q62559 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ift52Q62559 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ift52Q62559 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ift52Q62559 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ift52Q62559 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ift52Q62559 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ift52Q62559 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ift52Q62559 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ift52Q62559 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ift52Q62559 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ift52Q62559 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ift52Q62559 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ift52Q62559 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ift52Q62559 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ift52Q62559 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ift52Q62559 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ift52Q62559 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ift52Q62559 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ift52Q62559 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ift52Q62559 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ift52Q62559 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ift52Q62559 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Ift52Q62559 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ift52Q62559 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ift52Q62559 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Ift52Q62559 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ift52Q62559 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Ift52Q62559 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ift52Q62559 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ift52Q62559 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Ift52Q62559 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ift52Q62559 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ift52Q62559 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ift52Q62559 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ift52Q62559 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ift52Q62559 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ift52Q62559 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ift52Q62559 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ift52Q62559 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ift52Q62559 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ift52Q62559 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ift52Q62559 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ift52Q62559 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ift52Q62559 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ift52Q62559 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ift52Q62559 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ift52Q62559 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms