Protein–RNA interactions for Protein: Q62433

Ndrg1, Protein NDRG1, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndrg1Q62433 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ndrg1Q62433 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ndrg1Q62433 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ndrg1Q62433 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ndrg1Q62433 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ndrg1Q62433 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ndrg1Q62433 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ndrg1Q62433 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ndrg1Q62433 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ndrg1Q62433 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ndrg1Q62433 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ndrg1Q62433 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ndrg1Q62433 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ndrg1Q62433 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ndrg1Q62433 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ndrg1Q62433 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ndrg1Q62433 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ndrg1Q62433 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ndrg1Q62433 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ndrg1Q62433 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ndrg1Q62433 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ndrg1Q62433 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ndrg1Q62433 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ndrg1Q62433 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ndrg1Q62433 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ndrg1Q62433 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ndrg1Q62433 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ndrg1Q62433 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ndrg1Q62433 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ndrg1Q62433 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ndrg1Q62433 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ndrg1Q62433 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ndrg1Q62433 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ndrg1Q62433 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ndrg1Q62433 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ndrg1Q62433 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ndrg1Q62433 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ndrg1Q62433 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ndrg1Q62433 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ndrg1Q62433 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ndrg1Q62433 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ndrg1Q62433 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ndrg1Q62433 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ndrg1Q62433 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ndrg1Q62433 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ndrg1Q62433 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ndrg1Q62433 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ndrg1Q62433 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ndrg1Q62433 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ndrg1Q62433 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ndrg1Q62433 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ndrg1Q62433 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ndrg1Q62433 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ndrg1Q62433 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ndrg1Q62433 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ndrg1Q62433 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ndrg1Q62433 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ndrg1Q62433 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ndrg1Q62433 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ndrg1Q62433 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ndrg1Q62433 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ndrg1Q62433 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ndrg1Q62433 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ndrg1Q62433 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ndrg1Q62433 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ndrg1Q62433 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ndrg1Q62433 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ndrg1Q62433 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ndrg1Q62433 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ndrg1Q62433 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ndrg1Q62433 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ndrg1Q62433 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ndrg1Q62433 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ndrg1Q62433 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ndrg1Q62433 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ndrg1Q62433 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ndrg1Q62433 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ndrg1Q62433 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ndrg1Q62433 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ndrg1Q62433 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ndrg1Q62433 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ndrg1Q62433 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ndrg1Q62433 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ndrg1Q62433 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ndrg1Q62433 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ndrg1Q62433 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ndrg1Q62433 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ndrg1Q62433 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ndrg1Q62433 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ndrg1Q62433 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ndrg1Q62433 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ndrg1Q62433 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ndrg1Q62433 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ndrg1Q62433 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ndrg1Q62433 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ndrg1Q62433 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ndrg1Q62433 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ndrg1Q62433 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ndrg1Q62433 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ndrg1Q62433 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms