Protein–RNA interactions for Protein: Q62288

Spock1, Testican-1, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spock1Q62288 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spock1Q62288 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spock1Q62288 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spock1Q62288 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spock1Q62288 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spock1Q62288 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Spock1Q62288 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spock1Q62288 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spock1Q62288 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spock1Q62288 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spock1Q62288 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spock1Q62288 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spock1Q62288 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spock1Q62288 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spock1Q62288 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spock1Q62288 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spock1Q62288 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spock1Q62288 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spock1Q62288 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spock1Q62288 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spock1Q62288 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spock1Q62288 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spock1Q62288 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spock1Q62288 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Spock1Q62288 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spock1Q62288 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spock1Q62288 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spock1Q62288 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spock1Q62288 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spock1Q62288 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spock1Q62288 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spock1Q62288 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spock1Q62288 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spock1Q62288 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spock1Q62288 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spock1Q62288 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spock1Q62288 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spock1Q62288 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spock1Q62288 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spock1Q62288 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spock1Q62288 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spock1Q62288 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spock1Q62288 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spock1Q62288 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spock1Q62288 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Spock1Q62288 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spock1Q62288 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spock1Q62288 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spock1Q62288 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Spock1Q62288 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spock1Q62288 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spock1Q62288 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spock1Q62288 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spock1Q62288 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spock1Q62288 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spock1Q62288 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spock1Q62288 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spock1Q62288 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spock1Q62288 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spock1Q62288 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spock1Q62288 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spock1Q62288 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spock1Q62288 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spock1Q62288 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spock1Q62288 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spock1Q62288 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spock1Q62288 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spock1Q62288 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spock1Q62288 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spock1Q62288 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Spock1Q62288 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spock1Q62288 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spock1Q62288 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spock1Q62288 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spock1Q62288 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spock1Q62288 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spock1Q62288 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spock1Q62288 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spock1Q62288 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spock1Q62288 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spock1Q62288 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spock1Q62288 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spock1Q62288 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spock1Q62288 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spock1Q62288 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Spock1Q62288 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spock1Q62288 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spock1Q62288 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spock1Q62288 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spock1Q62288 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spock1Q62288 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spock1Q62288 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spock1Q62288 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spock1Q62288 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spock1Q62288 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Spock1Q62288 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spock1Q62288 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spock1Q62288 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spock1Q62288 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Spock1Q62288 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.7 ms