Protein–RNA interactions for Protein: Q62255

Sall3, Sal-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall3Q62255 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sall3Q62255 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sall3Q62255 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sall3Q62255 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sall3Q62255 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sall3Q62255 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sall3Q62255 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sall3Q62255 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sall3Q62255 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sall3Q62255 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sall3Q62255 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sall3Q62255 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sall3Q62255 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sall3Q62255 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sall3Q62255 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sall3Q62255 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sall3Q62255 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sall3Q62255 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sall3Q62255 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sall3Q62255 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sall3Q62255 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sall3Q62255 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sall3Q62255 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sall3Q62255 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sall3Q62255 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sall3Q62255 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sall3Q62255 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sall3Q62255 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sall3Q62255 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sall3Q62255 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sall3Q62255 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sall3Q62255 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sall3Q62255 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sall3Q62255 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sall3Q62255 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sall3Q62255 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sall3Q62255 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sall3Q62255 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Sall3Q62255 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Sall3Q62255 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Sall3Q62255 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Sall3Q62255 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Sall3Q62255 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Sall3Q62255 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Sall3Q62255 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Sall3Q62255 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Sall3Q62255 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Sall3Q62255 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Sall3Q62255 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Sall3Q62255 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sall3Q62255 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sall3Q62255 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sall3Q62255 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Sall3Q62255 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sall3Q62255 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sall3Q62255 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sall3Q62255 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sall3Q62255 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sall3Q62255 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sall3Q62255 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Sall3Q62255 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sall3Q62255 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sall3Q62255 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sall3Q62255 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sall3Q62255 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sall3Q62255 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sall3Q62255 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sall3Q62255 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Sall3Q62255 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sall3Q62255 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sall3Q62255 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sall3Q62255 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sall3Q62255 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sall3Q62255 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Sall3Q62255 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sall3Q62255 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sall3Q62255 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sall3Q62255 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sall3Q62255 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sall3Q62255 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sall3Q62255 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sall3Q62255 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sall3Q62255 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sall3Q62255 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Sall3Q62255 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sall3Q62255 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sall3Q62255 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sall3Q62255 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sall3Q62255 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sall3Q62255 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sall3Q62255 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sall3Q62255 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sall3Q62255 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Sall3Q62255 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sall3Q62255 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sall3Q62255 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sall3Q62255 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sall3Q62255 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sall3Q62255 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sall3Q62255 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms