Protein–RNA interactions for Protein: Q62158

Trim27, Zinc finger protein RFP, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim27Q62158 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trim27Q62158 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trim27Q62158 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trim27Q62158 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trim27Q62158 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trim27Q62158 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trim27Q62158 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trim27Q62158 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trim27Q62158 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Trim27Q62158 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trim27Q62158 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trim27Q62158 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trim27Q62158 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trim27Q62158 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trim27Q62158 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Trim27Q62158 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trim27Q62158 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trim27Q62158 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trim27Q62158 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trim27Q62158 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trim27Q62158 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trim27Q62158 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trim27Q62158 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim27Q62158 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim27Q62158 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim27Q62158 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim27Q62158 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim27Q62158 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim27Q62158 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim27Q62158 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim27Q62158 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim27Q62158 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim27Q62158 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim27Q62158 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim27Q62158 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim27Q62158 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim27Q62158 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim27Q62158 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim27Q62158 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim27Q62158 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim27Q62158 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim27Q62158 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim27Q62158 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim27Q62158 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim27Q62158 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim27Q62158 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim27Q62158 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim27Q62158 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim27Q62158 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim27Q62158 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim27Q62158 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trim27Q62158 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Trim27Q62158 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trim27Q62158 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
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Trim27Q62158 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Trim27Q62158 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trim27Q62158 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Trim27Q62158 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Trim27Q62158 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
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Trim27Q62158 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim27Q62158 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim27Q62158 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
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Trim27Q62158 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim27Q62158 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim27Q62158 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim27Q62158 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim27Q62158 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim27Q62158 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim27Q62158 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim27Q62158 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim27Q62158 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim27Q62158 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim27Q62158 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim27Q62158 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim27Q62158 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim27Q62158 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim27Q62158 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim27Q62158 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim27Q62158 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim27Q62158 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim27Q62158 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim27Q62158 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim27Q62158 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim27Q62158 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim27Q62158 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim27Q62158 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim27Q62158 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim27Q62158 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim27Q62158 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim27Q62158 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
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