Protein–RNA interactions for Protein: Q62035

Ptafr, Platelet-activating factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtafrQ62035 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PtafrQ62035 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PtafrQ62035 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PtafrQ62035 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PtafrQ62035 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PtafrQ62035 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PtafrQ62035 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PtafrQ62035 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PtafrQ62035 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PtafrQ62035 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PtafrQ62035 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PtafrQ62035 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PtafrQ62035 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PtafrQ62035 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PtafrQ62035 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PtafrQ62035 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PtafrQ62035 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PtafrQ62035 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PtafrQ62035 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PtafrQ62035 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PtafrQ62035 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PtafrQ62035 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PtafrQ62035 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PtafrQ62035 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PtafrQ62035 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PtafrQ62035 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PtafrQ62035 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PtafrQ62035 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PtafrQ62035 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PtafrQ62035 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PtafrQ62035 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PtafrQ62035 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PtafrQ62035 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PtafrQ62035 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PtafrQ62035 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PtafrQ62035 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PtafrQ62035 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PtafrQ62035 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PtafrQ62035 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PtafrQ62035 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PtafrQ62035 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PtafrQ62035 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PtafrQ62035 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PtafrQ62035 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PtafrQ62035 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PtafrQ62035 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PtafrQ62035 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PtafrQ62035 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PtafrQ62035 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PtafrQ62035 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PtafrQ62035 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PtafrQ62035 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PtafrQ62035 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PtafrQ62035 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PtafrQ62035 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PtafrQ62035 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PtafrQ62035 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PtafrQ62035 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PtafrQ62035 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PtafrQ62035 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PtafrQ62035 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PtafrQ62035 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PtafrQ62035 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PtafrQ62035 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PtafrQ62035 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PtafrQ62035 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PtafrQ62035 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PtafrQ62035 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PtafrQ62035 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PtafrQ62035 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PtafrQ62035 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PtafrQ62035 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PtafrQ62035 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PtafrQ62035 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PtafrQ62035 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PtafrQ62035 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PtafrQ62035 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PtafrQ62035 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PtafrQ62035 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PtafrQ62035 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PtafrQ62035 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PtafrQ62035 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PtafrQ62035 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PtafrQ62035 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PtafrQ62035 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PtafrQ62035 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PtafrQ62035 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PtafrQ62035 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PtafrQ62035 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PtafrQ62035 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PtafrQ62035 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PtafrQ62035 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PtafrQ62035 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PtafrQ62035 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PtafrQ62035 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PtafrQ62035 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PtafrQ62035 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PtafrQ62035 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PtafrQ62035 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PtafrQ62035 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms