Protein–RNA interactions for Protein: Q61657

Hes3, Transcription factor HES-3, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hes3Q61657 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hes3Q61657 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hes3Q61657 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hes3Q61657 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hes3Q61657 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hes3Q61657 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hes3Q61657 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hes3Q61657 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hes3Q61657 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hes3Q61657 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hes3Q61657 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hes3Q61657 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hes3Q61657 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hes3Q61657 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hes3Q61657 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hes3Q61657 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hes3Q61657 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hes3Q61657 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hes3Q61657 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hes3Q61657 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hes3Q61657 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hes3Q61657 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hes3Q61657 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hes3Q61657 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Hes3Q61657 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hes3Q61657 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hes3Q61657 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hes3Q61657 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hes3Q61657 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hes3Q61657 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hes3Q61657 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hes3Q61657 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hes3Q61657 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hes3Q61657 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Hes3Q61657 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Hes3Q61657 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hes3Q61657 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hes3Q61657 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hes3Q61657 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hes3Q61657 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Hes3Q61657 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hes3Q61657 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hes3Q61657 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hes3Q61657 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hes3Q61657 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hes3Q61657 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hes3Q61657 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hes3Q61657 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hes3Q61657 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hes3Q61657 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hes3Q61657 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hes3Q61657 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hes3Q61657 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hes3Q61657 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Hes3Q61657 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hes3Q61657 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hes3Q61657 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hes3Q61657 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hes3Q61657 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hes3Q61657 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hes3Q61657 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hes3Q61657 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hes3Q61657 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hes3Q61657 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hes3Q61657 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hes3Q61657 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hes3Q61657 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hes3Q61657 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hes3Q61657 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hes3Q61657 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Hes3Q61657 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hes3Q61657 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hes3Q61657 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Hes3Q61657 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hes3Q61657 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hes3Q61657 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hes3Q61657 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hes3Q61657 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Hes3Q61657 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hes3Q61657 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hes3Q61657 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hes3Q61657 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hes3Q61657 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hes3Q61657 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hes3Q61657 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hes3Q61657 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hes3Q61657 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hes3Q61657 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hes3Q61657 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hes3Q61657 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hes3Q61657 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hes3Q61657 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hes3Q61657 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hes3Q61657 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hes3Q61657 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hes3Q61657 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hes3Q61657 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hes3Q61657 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hes3Q61657 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hes3Q61657 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms