Protein–RNA interactions for Protein: Q61476

Cd55b, Complement decay-accelerating factor transmembrane isoform, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd55bQ61476 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd55bQ61476 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd55bQ61476 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd55bQ61476 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd55bQ61476 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd55bQ61476 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd55bQ61476 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd55bQ61476 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd55bQ61476 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd55bQ61476 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd55bQ61476 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd55bQ61476 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd55bQ61476 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd55bQ61476 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd55bQ61476 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd55bQ61476 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd55bQ61476 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd55bQ61476 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd55bQ61476 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd55bQ61476 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd55bQ61476 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd55bQ61476 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd55bQ61476 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd55bQ61476 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd55bQ61476 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd55bQ61476 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd55bQ61476 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd55bQ61476 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd55bQ61476 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd55bQ61476 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd55bQ61476 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd55bQ61476 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd55bQ61476 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd55bQ61476 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd55bQ61476 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd55bQ61476 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd55bQ61476 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd55bQ61476 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd55bQ61476 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd55bQ61476 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd55bQ61476 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd55bQ61476 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd55bQ61476 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd55bQ61476 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd55bQ61476 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd55bQ61476 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd55bQ61476 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd55bQ61476 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd55bQ61476 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd55bQ61476 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd55bQ61476 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd55bQ61476 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd55bQ61476 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd55bQ61476 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd55bQ61476 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd55bQ61476 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd55bQ61476 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd55bQ61476 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd55bQ61476 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd55bQ61476 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd55bQ61476 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd55bQ61476 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd55bQ61476 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd55bQ61476 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd55bQ61476 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd55bQ61476 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd55bQ61476 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd55bQ61476 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd55bQ61476 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd55bQ61476 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd55bQ61476 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd55bQ61476 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd55bQ61476 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd55bQ61476 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd55bQ61476 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd55bQ61476 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd55bQ61476 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd55bQ61476 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd55bQ61476 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd55bQ61476 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd55bQ61476 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd55bQ61476 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd55bQ61476 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd55bQ61476 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd55bQ61476 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd55bQ61476 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd55bQ61476 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd55bQ61476 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd55bQ61476 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd55bQ61476 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd55bQ61476 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd55bQ61476 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd55bQ61476 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd55bQ61476 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd55bQ61476 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd55bQ61476 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd55bQ61476 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd55bQ61476 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd55bQ61476 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd55bQ61476 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms