Protein–RNA interactions for Protein: Q61451

Cd53, Leukocyte surface antigen CD53, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd53Q61451 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd53Q61451 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd53Q61451 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd53Q61451 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd53Q61451 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd53Q61451 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd53Q61451 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd53Q61451 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd53Q61451 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd53Q61451 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd53Q61451 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd53Q61451 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd53Q61451 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd53Q61451 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd53Q61451 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd53Q61451 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd53Q61451 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd53Q61451 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd53Q61451 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd53Q61451 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd53Q61451 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd53Q61451 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd53Q61451 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd53Q61451 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd53Q61451 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd53Q61451 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd53Q61451 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd53Q61451 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd53Q61451 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd53Q61451 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd53Q61451 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd53Q61451 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd53Q61451 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd53Q61451 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd53Q61451 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd53Q61451 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd53Q61451 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd53Q61451 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd53Q61451 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd53Q61451 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd53Q61451 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd53Q61451 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd53Q61451 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd53Q61451 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd53Q61451 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd53Q61451 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd53Q61451 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd53Q61451 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd53Q61451 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd53Q61451 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd53Q61451 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd53Q61451 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd53Q61451 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd53Q61451 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd53Q61451 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd53Q61451 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd53Q61451 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd53Q61451 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd53Q61451 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd53Q61451 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd53Q61451 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd53Q61451 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd53Q61451 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd53Q61451 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd53Q61451 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd53Q61451 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd53Q61451 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd53Q61451 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd53Q61451 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd53Q61451 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd53Q61451 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd53Q61451 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd53Q61451 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd53Q61451 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd53Q61451 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd53Q61451 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd53Q61451 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd53Q61451 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd53Q61451 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd53Q61451 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd53Q61451 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd53Q61451 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd53Q61451 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd53Q61451 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd53Q61451 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd53Q61451 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd53Q61451 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd53Q61451 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd53Q61451 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd53Q61451 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd53Q61451 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd53Q61451 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd53Q61451 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd53Q61451 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd53Q61451 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd53Q61451 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd53Q61451 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd53Q61451 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd53Q61451 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd53Q61451 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms