Protein–RNA interactions for Protein: Q61179

Irf9, Interferon regulatory factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf9Q61179 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Irf9Q61179 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Irf9Q61179 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Irf9Q61179 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Irf9Q61179 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Irf9Q61179 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Irf9Q61179 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Irf9Q61179 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Irf9Q61179 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Irf9Q61179 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Irf9Q61179 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Irf9Q61179 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Irf9Q61179 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Irf9Q61179 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Irf9Q61179 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Irf9Q61179 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Irf9Q61179 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Irf9Q61179 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Irf9Q61179 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Irf9Q61179 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Irf9Q61179 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Irf9Q61179 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Irf9Q61179 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Irf9Q61179 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Irf9Q61179 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Irf9Q61179 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Irf9Q61179 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Irf9Q61179 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Irf9Q61179 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Irf9Q61179 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Irf9Q61179 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Irf9Q61179 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Irf9Q61179 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Irf9Q61179 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Irf9Q61179 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Irf9Q61179 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Irf9Q61179 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Irf9Q61179 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Irf9Q61179 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Irf9Q61179 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Irf9Q61179 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Irf9Q61179 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Irf9Q61179 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Irf9Q61179 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Irf9Q61179 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Irf9Q61179 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Irf9Q61179 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Irf9Q61179 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Irf9Q61179 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Irf9Q61179 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Irf9Q61179 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Irf9Q61179 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Irf9Q61179 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Irf9Q61179 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Irf9Q61179 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Irf9Q61179 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Irf9Q61179 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Irf9Q61179 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Irf9Q61179 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Irf9Q61179 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Irf9Q61179 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Irf9Q61179 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Irf9Q61179 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Irf9Q61179 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Irf9Q61179 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Irf9Q61179 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Irf9Q61179 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Irf9Q61179 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Irf9Q61179 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Irf9Q61179 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Irf9Q61179 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Irf9Q61179 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Irf9Q61179 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Irf9Q61179 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Irf9Q61179 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Irf9Q61179 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Irf9Q61179 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Irf9Q61179 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Irf9Q61179 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Irf9Q61179 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Irf9Q61179 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Irf9Q61179 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Irf9Q61179 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Irf9Q61179 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Irf9Q61179 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Irf9Q61179 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Irf9Q61179 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Irf9Q61179 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Irf9Q61179 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Irf9Q61179 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Irf9Q61179 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Irf9Q61179 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Irf9Q61179 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Irf9Q61179 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Irf9Q61179 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Irf9Q61179 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Irf9Q61179 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Irf9Q61179 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Irf9Q61179 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Irf9Q61179 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms