Protein–RNA interactions for Protein: Q61033

Tmpo, Lamina-associated polypeptide 2, isoforms alpha/zeta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TmpoQ61033 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TmpoQ61033 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TmpoQ61033 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TmpoQ61033 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TmpoQ61033 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TmpoQ61033 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TmpoQ61033 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TmpoQ61033 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TmpoQ61033 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TmpoQ61033 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TmpoQ61033 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TmpoQ61033 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TmpoQ61033 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TmpoQ61033 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TmpoQ61033 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TmpoQ61033 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TmpoQ61033 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TmpoQ61033 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TmpoQ61033 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TmpoQ61033 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TmpoQ61033 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TmpoQ61033 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TmpoQ61033 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TmpoQ61033 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TmpoQ61033 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TmpoQ61033 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TmpoQ61033 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TmpoQ61033 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
TmpoQ61033 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TmpoQ61033 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TmpoQ61033 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TmpoQ61033 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TmpoQ61033 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TmpoQ61033 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TmpoQ61033 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TmpoQ61033 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TmpoQ61033 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TmpoQ61033 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TmpoQ61033 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TmpoQ61033 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TmpoQ61033 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TmpoQ61033 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TmpoQ61033 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TmpoQ61033 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TmpoQ61033 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TmpoQ61033 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TmpoQ61033 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TmpoQ61033 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TmpoQ61033 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TmpoQ61033 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TmpoQ61033 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TmpoQ61033 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TmpoQ61033 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TmpoQ61033 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TmpoQ61033 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TmpoQ61033 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TmpoQ61033 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TmpoQ61033 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TmpoQ61033 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TmpoQ61033 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TmpoQ61033 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TmpoQ61033 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TmpoQ61033 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TmpoQ61033 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TmpoQ61033 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TmpoQ61033 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TmpoQ61033 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TmpoQ61033 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TmpoQ61033 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TmpoQ61033 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TmpoQ61033 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TmpoQ61033 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TmpoQ61033 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TmpoQ61033 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TmpoQ61033 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TmpoQ61033 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TmpoQ61033 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TmpoQ61033 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TmpoQ61033 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TmpoQ61033 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TmpoQ61033 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TmpoQ61033 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TmpoQ61033 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TmpoQ61033 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TmpoQ61033 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TmpoQ61033 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TmpoQ61033 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TmpoQ61033 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TmpoQ61033 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TmpoQ61033 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
TmpoQ61033 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TmpoQ61033 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TmpoQ61033 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TmpoQ61033 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TmpoQ61033 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TmpoQ61033 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TmpoQ61033 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TmpoQ61033 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TmpoQ61033 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TmpoQ61033 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms