Protein–RNA interactions for Protein: Q60973

Rbbp7, Histone-binding protein RBBP7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp7Q60973 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rbbp7Q60973 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rbbp7Q60973 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rbbp7Q60973 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rbbp7Q60973 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rbbp7Q60973 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rbbp7Q60973 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rbbp7Q60973 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rbbp7Q60973 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rbbp7Q60973 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rbbp7Q60973 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rbbp7Q60973 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rbbp7Q60973 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Rbbp7Q60973 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Rbbp7Q60973 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rbbp7Q60973 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rbbp7Q60973 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rbbp7Q60973 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rbbp7Q60973 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rbbp7Q60973 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rbbp7Q60973 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rbbp7Q60973 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rbbp7Q60973 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rbbp7Q60973 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rbbp7Q60973 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rbbp7Q60973 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rbbp7Q60973 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rbbp7Q60973 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rbbp7Q60973 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rbbp7Q60973 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rbbp7Q60973 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rbbp7Q60973 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rbbp7Q60973 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rbbp7Q60973 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rbbp7Q60973 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rbbp7Q60973 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rbbp7Q60973 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rbbp7Q60973 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rbbp7Q60973 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rbbp7Q60973 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rbbp7Q60973 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rbbp7Q60973 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Rbbp7Q60973 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rbbp7Q60973 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rbbp7Q60973 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rbbp7Q60973 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rbbp7Q60973 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rbbp7Q60973 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rbbp7Q60973 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rbbp7Q60973 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rbbp7Q60973 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rbbp7Q60973 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rbbp7Q60973 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rbbp7Q60973 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rbbp7Q60973 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rbbp7Q60973 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rbbp7Q60973 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rbbp7Q60973 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rbbp7Q60973 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rbbp7Q60973 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rbbp7Q60973 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rbbp7Q60973 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rbbp7Q60973 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rbbp7Q60973 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rbbp7Q60973 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Rbbp7Q60973 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rbbp7Q60973 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Rbbp7Q60973 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rbbp7Q60973 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Rbbp7Q60973 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rbbp7Q60973 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rbbp7Q60973 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rbbp7Q60973 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rbbp7Q60973 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Rbbp7Q60973 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rbbp7Q60973 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rbbp7Q60973 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rbbp7Q60973 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rbbp7Q60973 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rbbp7Q60973 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rbbp7Q60973 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rbbp7Q60973 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rbbp7Q60973 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Rbbp7Q60973 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rbbp7Q60973 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rbbp7Q60973 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rbbp7Q60973 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rbbp7Q60973 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rbbp7Q60973 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rbbp7Q60973 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rbbp7Q60973 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rbbp7Q60973 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rbbp7Q60973 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rbbp7Q60973 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rbbp7Q60973 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rbbp7Q60973 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rbbp7Q60973 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rbbp7Q60973 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rbbp7Q60973 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rbbp7Q60973 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms