Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rbbp4Q60972 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rbbp4Q60972 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rbbp4Q60972 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rbbp4Q60972 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rbbp4Q60972 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rbbp4Q60972 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rbbp4Q60972 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rbbp4Q60972 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rbbp4Q60972 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rbbp4Q60972 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rbbp4Q60972 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Rbbp4Q60972 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rbbp4Q60972 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rbbp4Q60972 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rbbp4Q60972 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rbbp4Q60972 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rbbp4Q60972 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rbbp4Q60972 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rbbp4Q60972 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rbbp4Q60972 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rbbp4Q60972 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rbbp4Q60972 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rbbp4Q60972 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rbbp4Q60972 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rbbp4Q60972 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rbbp4Q60972 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rbbp4Q60972 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rbbp4Q60972 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rbbp4Q60972 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rbbp4Q60972 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rbbp4Q60972 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rbbp4Q60972 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rbbp4Q60972 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rbbp4Q60972 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rbbp4Q60972 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rbbp4Q60972 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rbbp4Q60972 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rbbp4Q60972 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rbbp4Q60972 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rbbp4Q60972 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rbbp4Q60972 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rbbp4Q60972 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rbbp4Q60972 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rbbp4Q60972 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rbbp4Q60972 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rbbp4Q60972 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rbbp4Q60972 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rbbp4Q60972 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rbbp4Q60972 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rbbp4Q60972 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rbbp4Q60972 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rbbp4Q60972 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rbbp4Q60972 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Rbbp4Q60972 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rbbp4Q60972 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rbbp4Q60972 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rbbp4Q60972 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rbbp4Q60972 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rbbp4Q60972 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rbbp4Q60972 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rbbp4Q60972 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Rbbp4Q60972 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rbbp4Q60972 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rbbp4Q60972 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Rbbp4Q60972 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rbbp4Q60972 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Rbbp4Q60972 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rbbp4Q60972 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rbbp4Q60972 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rbbp4Q60972 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rbbp4Q60972 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rbbp4Q60972 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rbbp4Q60972 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rbbp4Q60972 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rbbp4Q60972 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rbbp4Q60972 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rbbp4Q60972 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Rbbp4Q60972 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rbbp4Q60972 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rbbp4Q60972 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rbbp4Q60972 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rbbp4Q60972 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rbbp4Q60972 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rbbp4Q60972 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rbbp4Q60972 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rbbp4Q60972 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rbbp4Q60972 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rbbp4Q60972 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rbbp4Q60972 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rbbp4Q60972 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rbbp4Q60972 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rbbp4Q60972 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rbbp4Q60972 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rbbp4Q60972 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rbbp4Q60972 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rbbp4Q60972 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rbbp4Q60972 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rbbp4Q60972 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rbbp4Q60972 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms