Protein–RNA interactions for Protein: Q60662

Akap4, A-kinase anchor protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 849 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Akap4Q60662 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Akap4Q60662 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Akap4Q60662 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Akap4Q60662 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Akap4Q60662 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Akap4Q60662 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Akap4Q60662 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Akap4Q60662 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Akap4Q60662 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Akap4Q60662 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Akap4Q60662 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Akap4Q60662 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Akap4Q60662 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Akap4Q60662 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Akap4Q60662 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Akap4Q60662 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Akap4Q60662 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Akap4Q60662 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Akap4Q60662 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Akap4Q60662 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Akap4Q60662 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Akap4Q60662 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Akap4Q60662 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Akap4Q60662 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Akap4Q60662 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Akap4Q60662 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Akap4Q60662 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Akap4Q60662 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Akap4Q60662 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Akap4Q60662 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Akap4Q60662 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Akap4Q60662 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Akap4Q60662 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Akap4Q60662 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Akap4Q60662 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Akap4Q60662 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Akap4Q60662 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Akap4Q60662 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Akap4Q60662 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Akap4Q60662 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Akap4Q60662 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Akap4Q60662 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Akap4Q60662 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Akap4Q60662 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Akap4Q60662 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Akap4Q60662 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Akap4Q60662 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Akap4Q60662 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Akap4Q60662 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Akap4Q60662 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Akap4Q60662 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Akap4Q60662 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Akap4Q60662 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Akap4Q60662 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Akap4Q60662 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Akap4Q60662 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Akap4Q60662 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Akap4Q60662 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Akap4Q60662 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Akap4Q60662 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Akap4Q60662 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Akap4Q60662 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Akap4Q60662 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Akap4Q60662 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Akap4Q60662 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Akap4Q60662 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Akap4Q60662 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Akap4Q60662 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Akap4Q60662 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Akap4Q60662 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Akap4Q60662 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Akap4Q60662 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Akap4Q60662 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Akap4Q60662 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Akap4Q60662 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Akap4Q60662 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Akap4Q60662 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Akap4Q60662 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Akap4Q60662 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Akap4Q60662 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Akap4Q60662 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Akap4Q60662 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Akap4Q60662 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Akap4Q60662 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Akap4Q60662 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Akap4Q60662 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Akap4Q60662 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Akap4Q60662 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Akap4Q60662 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Akap4Q60662 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Akap4Q60662 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Akap4Q60662 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Akap4Q60662 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Akap4Q60662 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Akap4Q60662 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Akap4Q60662 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Akap4Q60662 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Akap4Q60662 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Akap4Q60662 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Akap4Q60662 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms