Protein–RNA interactions for Protein: Q60649

Clpb, Caseinolytic peptidase B protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClpbQ60649 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ClpbQ60649 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ClpbQ60649 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ClpbQ60649 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ClpbQ60649 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ClpbQ60649 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ClpbQ60649 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ClpbQ60649 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ClpbQ60649 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ClpbQ60649 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ClpbQ60649 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ClpbQ60649 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ClpbQ60649 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ClpbQ60649 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ClpbQ60649 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ClpbQ60649 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ClpbQ60649 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ClpbQ60649 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ClpbQ60649 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ClpbQ60649 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ClpbQ60649 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ClpbQ60649 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ClpbQ60649 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ClpbQ60649 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ClpbQ60649 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ClpbQ60649 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ClpbQ60649 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ClpbQ60649 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ClpbQ60649 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ClpbQ60649 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ClpbQ60649 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ClpbQ60649 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ClpbQ60649 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ClpbQ60649 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ClpbQ60649 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
ClpbQ60649 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ClpbQ60649 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ClpbQ60649 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
ClpbQ60649 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
ClpbQ60649 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ClpbQ60649 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ClpbQ60649 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ClpbQ60649 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ClpbQ60649 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ClpbQ60649 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ClpbQ60649 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ClpbQ60649 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ClpbQ60649 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ClpbQ60649 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ClpbQ60649 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ClpbQ60649 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ClpbQ60649 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ClpbQ60649 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
ClpbQ60649 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
ClpbQ60649 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ClpbQ60649 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ClpbQ60649 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ClpbQ60649 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ClpbQ60649 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ClpbQ60649 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ClpbQ60649 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ClpbQ60649 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ClpbQ60649 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ClpbQ60649 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ClpbQ60649 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ClpbQ60649 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ClpbQ60649 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ClpbQ60649 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ClpbQ60649 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ClpbQ60649 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ClpbQ60649 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ClpbQ60649 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ClpbQ60649 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ClpbQ60649 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ClpbQ60649 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ClpbQ60649 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ClpbQ60649 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ClpbQ60649 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ClpbQ60649 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ClpbQ60649 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ClpbQ60649 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ClpbQ60649 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ClpbQ60649 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ClpbQ60649 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ClpbQ60649 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ClpbQ60649 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ClpbQ60649 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ClpbQ60649 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ClpbQ60649 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ClpbQ60649 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ClpbQ60649 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ClpbQ60649 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ClpbQ60649 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ClpbQ60649 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ClpbQ60649 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ClpbQ60649 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ClpbQ60649 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ClpbQ60649 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ClpbQ60649 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ClpbQ60649 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms