Protein–RNA interactions for Protein: Q60520

Sin3a, Paired amphipathic helix protein Sin3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3aQ60520 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sin3aQ60520 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sin3aQ60520 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sin3aQ60520 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sin3aQ60520 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sin3aQ60520 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Sin3aQ60520 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sin3aQ60520 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sin3aQ60520 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sin3aQ60520 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sin3aQ60520 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sin3aQ60520 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Sin3aQ60520 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sin3aQ60520 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sin3aQ60520 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sin3aQ60520 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sin3aQ60520 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sin3aQ60520 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sin3aQ60520 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sin3aQ60520 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sin3aQ60520 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sin3aQ60520 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sin3aQ60520 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sin3aQ60520 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sin3aQ60520 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sin3aQ60520 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sin3aQ60520 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sin3aQ60520 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sin3aQ60520 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sin3aQ60520 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sin3aQ60520 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sin3aQ60520 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sin3aQ60520 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sin3aQ60520 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sin3aQ60520 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sin3aQ60520 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sin3aQ60520 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sin3aQ60520 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sin3aQ60520 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sin3aQ60520 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Sin3aQ60520 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Sin3aQ60520 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sin3aQ60520 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sin3aQ60520 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sin3aQ60520 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sin3aQ60520 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sin3aQ60520 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sin3aQ60520 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sin3aQ60520 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sin3aQ60520 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sin3aQ60520 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sin3aQ60520 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sin3aQ60520 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sin3aQ60520 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sin3aQ60520 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sin3aQ60520 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sin3aQ60520 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Sin3aQ60520 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sin3aQ60520 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Sin3aQ60520 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sin3aQ60520 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sin3aQ60520 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sin3aQ60520 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sin3aQ60520 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sin3aQ60520 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sin3aQ60520 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sin3aQ60520 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sin3aQ60520 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sin3aQ60520 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sin3aQ60520 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sin3aQ60520 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sin3aQ60520 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sin3aQ60520 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sin3aQ60520 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sin3aQ60520 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sin3aQ60520 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sin3aQ60520 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sin3aQ60520 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sin3aQ60520 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sin3aQ60520 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sin3aQ60520 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sin3aQ60520 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sin3aQ60520 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Sin3aQ60520 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Sin3aQ60520 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Sin3aQ60520 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Sin3aQ60520 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Sin3aQ60520 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Sin3aQ60520 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sin3aQ60520 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sin3aQ60520 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Sin3aQ60520 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sin3aQ60520 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sin3aQ60520 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sin3aQ60520 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sin3aQ60520 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sin3aQ60520 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sin3aQ60520 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Sin3aQ60520 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sin3aQ60520 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms