Protein–RNA interactions for Protein: Q5U465

Ccdc125, Coiled-coil domain-containing protein 125, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc125Q5U465 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ccdc125Q5U465 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ccdc125Q5U465 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc125Q5U465 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc125Q5U465 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc125Q5U465 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc125Q5U465 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc125Q5U465 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc125Q5U465 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc125Q5U465 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc125Q5U465 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc125Q5U465 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc125Q5U465 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc125Q5U465 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc125Q5U465 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc125Q5U465 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc125Q5U465 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc125Q5U465 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc125Q5U465 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc125Q5U465 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc125Q5U465 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc125Q5U465 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc125Q5U465 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc125Q5U465 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc125Q5U465 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc125Q5U465 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc125Q5U465 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc125Q5U465 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc125Q5U465 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc125Q5U465 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc125Q5U465 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc125Q5U465 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc125Q5U465 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc125Q5U465 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc125Q5U465 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc125Q5U465 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc125Q5U465 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc125Q5U465 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc125Q5U465 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc125Q5U465 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc125Q5U465 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc125Q5U465 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc125Q5U465 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc125Q5U465 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc125Q5U465 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc125Q5U465 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc125Q5U465 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc125Q5U465 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc125Q5U465 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc125Q5U465 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc125Q5U465 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc125Q5U465 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc125Q5U465 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc125Q5U465 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc125Q5U465 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc125Q5U465 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc125Q5U465 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc125Q5U465 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc125Q5U465 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc125Q5U465 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc125Q5U465 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc125Q5U465 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc125Q5U465 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc125Q5U465 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc125Q5U465 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc125Q5U465 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc125Q5U465 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc125Q5U465 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc125Q5U465 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc125Q5U465 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc125Q5U465 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc125Q5U465 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc125Q5U465 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc125Q5U465 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc125Q5U465 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc125Q5U465 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc125Q5U465 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc125Q5U465 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc125Q5U465 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc125Q5U465 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc125Q5U465 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc125Q5U465 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc125Q5U465 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc125Q5U465 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc125Q5U465 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc125Q5U465 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc125Q5U465 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc125Q5U465 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc125Q5U465 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc125Q5U465 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc125Q5U465 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc125Q5U465 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc125Q5U465 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc125Q5U465 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc125Q5U465 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc125Q5U465 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc125Q5U465 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc125Q5U465 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc125Q5U465 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc125Q5U465 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms