Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV85

Synrg, Synergin gamma, mousemouse

Predictions only

Length 1,306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynrgQ5SV85 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SynrgQ5SV85 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SynrgQ5SV85 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SynrgQ5SV85 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SynrgQ5SV85 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SynrgQ5SV85 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SynrgQ5SV85 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SynrgQ5SV85 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SynrgQ5SV85 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SynrgQ5SV85 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SynrgQ5SV85 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SynrgQ5SV85 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SynrgQ5SV85 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SynrgQ5SV85 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SynrgQ5SV85 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SynrgQ5SV85 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SynrgQ5SV85 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SynrgQ5SV85 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SynrgQ5SV85 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SynrgQ5SV85 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SynrgQ5SV85 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SynrgQ5SV85 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SynrgQ5SV85 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SynrgQ5SV85 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SynrgQ5SV85 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SynrgQ5SV85 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SynrgQ5SV85 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SynrgQ5SV85 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SynrgQ5SV85 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SynrgQ5SV85 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SynrgQ5SV85 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SynrgQ5SV85 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SynrgQ5SV85 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SynrgQ5SV85 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SynrgQ5SV85 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SynrgQ5SV85 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SynrgQ5SV85 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SynrgQ5SV85 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SynrgQ5SV85 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SynrgQ5SV85 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SynrgQ5SV85 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SynrgQ5SV85 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SynrgQ5SV85 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SynrgQ5SV85 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SynrgQ5SV85 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SynrgQ5SV85 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SynrgQ5SV85 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SynrgQ5SV85 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SynrgQ5SV85 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SynrgQ5SV85 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SynrgQ5SV85 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SynrgQ5SV85 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SynrgQ5SV85 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SynrgQ5SV85 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SynrgQ5SV85 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SynrgQ5SV85 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SynrgQ5SV85 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SynrgQ5SV85 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SynrgQ5SV85 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SynrgQ5SV85 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SynrgQ5SV85 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SynrgQ5SV85 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SynrgQ5SV85 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SynrgQ5SV85 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SynrgQ5SV85 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SynrgQ5SV85 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SynrgQ5SV85 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SynrgQ5SV85 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SynrgQ5SV85 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SynrgQ5SV85 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SynrgQ5SV85 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SynrgQ5SV85 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SynrgQ5SV85 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
SynrgQ5SV85 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SynrgQ5SV85 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SynrgQ5SV85 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SynrgQ5SV85 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SynrgQ5SV85 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SynrgQ5SV85 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SynrgQ5SV85 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SynrgQ5SV85 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SynrgQ5SV85 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SynrgQ5SV85 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SynrgQ5SV85 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SynrgQ5SV85 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SynrgQ5SV85 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SynrgQ5SV85 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SynrgQ5SV85 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SynrgQ5SV85 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SynrgQ5SV85 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SynrgQ5SV85 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SynrgQ5SV85 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SynrgQ5SV85 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SynrgQ5SV85 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SynrgQ5SV85 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SynrgQ5SV85 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SynrgQ5SV85 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SynrgQ5SV85 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SynrgQ5SV85 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SynrgQ5SV85 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms