Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC3

Trim41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim41Q5NCC3 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
Trim41Q5NCC3 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Trim41Q5NCC3 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Trim41Q5NCC3 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Trim41Q5NCC3 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Trim41Q5NCC3 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Trim41Q5NCC3 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Trim41Q5NCC3 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Trim41Q5NCC3 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Trim41Q5NCC3 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Trim41Q5NCC3 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Trim41Q5NCC3 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Trim41Q5NCC3 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
Trim41Q5NCC3 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
Trim41Q5NCC3 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Trim41Q5NCC3 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Trim41Q5NCC3 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Trim41Q5NCC3 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Trim41Q5NCC3 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Trim41Q5NCC3 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Trim41Q5NCC3 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Trim41Q5NCC3 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Trim41Q5NCC3 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Trim41Q5NCC3 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Trim41Q5NCC3 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Trim41Q5NCC3 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Trim41Q5NCC3 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
Trim41Q5NCC3 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
Trim41Q5NCC3 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Trim41Q5NCC3 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Trim41Q5NCC3 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Trim41Q5NCC3 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Trim41Q5NCC3 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Trim41Q5NCC3 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Trim41Q5NCC3 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Trim41Q5NCC3 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Trim41Q5NCC3 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Trim41Q5NCC3 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Trim41Q5NCC3 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
Trim41Q5NCC3 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Trim41Q5NCC3 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Trim41Q5NCC3 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Trim41Q5NCC3 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Trim41Q5NCC3 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
Trim41Q5NCC3 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Trim41Q5NCC3 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Trim41Q5NCC3 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Trim41Q5NCC3 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
Trim41Q5NCC3 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Trim41Q5NCC3 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Trim41Q5NCC3 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
Trim41Q5NCC3 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Trim41Q5NCC3 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Trim41Q5NCC3 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Trim41Q5NCC3 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Trim41Q5NCC3 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Trim41Q5NCC3 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Trim41Q5NCC3 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Trim41Q5NCC3 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Trim41Q5NCC3 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
Trim41Q5NCC3 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Trim41Q5NCC3 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Trim41Q5NCC3 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Trim41Q5NCC3 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Trim41Q5NCC3 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Trim41Q5NCC3 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Trim41Q5NCC3 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Trim41Q5NCC3 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Trim41Q5NCC3 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Trim41Q5NCC3 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
Trim41Q5NCC3 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Trim41Q5NCC3 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
Trim41Q5NCC3 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
Trim41Q5NCC3 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Trim41Q5NCC3 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Trim41Q5NCC3 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Trim41Q5NCC3 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Trim41Q5NCC3 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Trim41Q5NCC3 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Trim41Q5NCC3 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Trim41Q5NCC3 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
Trim41Q5NCC3 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Trim41Q5NCC3 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Trim41Q5NCC3 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Trim41Q5NCC3 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Trim41Q5NCC3 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Trim41Q5NCC3 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Trim41Q5NCC3 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Trim41Q5NCC3 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Trim41Q5NCC3 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Trim41Q5NCC3 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Trim41Q5NCC3 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Trim41Q5NCC3 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Trim41Q5NCC3 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Trim41Q5NCC3 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Trim41Q5NCC3 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Trim41Q5NCC3 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Trim41Q5NCC3 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Trim41Q5NCC3 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Trim41Q5NCC3 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.5 ms