Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCB2

Gm12185, Predicted gene 12185, mousemouse

Predictions only

Length 835 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm12185Q5NCB2 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm12185Q5NCB2 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm12185Q5NCB2 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm12185Q5NCB2 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm12185Q5NCB2 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm12185Q5NCB2 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm12185Q5NCB2 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm12185Q5NCB2 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm12185Q5NCB2 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm12185Q5NCB2 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm12185Q5NCB2 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm12185Q5NCB2 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm12185Q5NCB2 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm12185Q5NCB2 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm12185Q5NCB2 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm12185Q5NCB2 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm12185Q5NCB2 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm12185Q5NCB2 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm12185Q5NCB2 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm12185Q5NCB2 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm12185Q5NCB2 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm12185Q5NCB2 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm12185Q5NCB2 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm12185Q5NCB2 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm12185Q5NCB2 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm12185Q5NCB2 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm12185Q5NCB2 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm12185Q5NCB2 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm12185Q5NCB2 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm12185Q5NCB2 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm12185Q5NCB2 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm12185Q5NCB2 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm12185Q5NCB2 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm12185Q5NCB2 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm12185Q5NCB2 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm12185Q5NCB2 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm12185Q5NCB2 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm12185Q5NCB2 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm12185Q5NCB2 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm12185Q5NCB2 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm12185Q5NCB2 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm12185Q5NCB2 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm12185Q5NCB2 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm12185Q5NCB2 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm12185Q5NCB2 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm12185Q5NCB2 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gm12185Q5NCB2 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gm12185Q5NCB2 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gm12185Q5NCB2 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gm12185Q5NCB2 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gm12185Q5NCB2 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gm12185Q5NCB2 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gm12185Q5NCB2 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm12185Q5NCB2 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm12185Q5NCB2 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm12185Q5NCB2 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm12185Q5NCB2 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm12185Q5NCB2 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm12185Q5NCB2 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm12185Q5NCB2 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm12185Q5NCB2 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm12185Q5NCB2 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm12185Q5NCB2 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm12185Q5NCB2 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm12185Q5NCB2 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm12185Q5NCB2 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm12185Q5NCB2 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm12185Q5NCB2 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm12185Q5NCB2 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm12185Q5NCB2 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm12185Q5NCB2 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm12185Q5NCB2 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm12185Q5NCB2 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm12185Q5NCB2 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm12185Q5NCB2 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm12185Q5NCB2 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm12185Q5NCB2 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm12185Q5NCB2 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm12185Q5NCB2 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm12185Q5NCB2 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm12185Q5NCB2 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm12185Q5NCB2 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm12185Q5NCB2 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm12185Q5NCB2 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm12185Q5NCB2 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm12185Q5NCB2 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm12185Q5NCB2 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm12185Q5NCB2 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm12185Q5NCB2 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm12185Q5NCB2 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm12185Q5NCB2 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm12185Q5NCB2 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm12185Q5NCB2 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm12185Q5NCB2 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm12185Q5NCB2 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm12185Q5NCB2 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm12185Q5NCB2 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm12185Q5NCB2 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm12185Q5NCB2 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm12185Q5NCB2 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms