Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC41

1810065E05Rik, RIKEN cDNA 1810065E05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1810065E05RikQ5NC41 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
1810065E05RikQ5NC41 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
1810065E05RikQ5NC41 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
1810065E05RikQ5NC41 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
1810065E05RikQ5NC41 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
1810065E05RikQ5NC41 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
1810065E05RikQ5NC41 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
1810065E05RikQ5NC41 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
1810065E05RikQ5NC41 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
1810065E05RikQ5NC41 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
1810065E05RikQ5NC41 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
1810065E05RikQ5NC41 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
1810065E05RikQ5NC41 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
1810065E05RikQ5NC41 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
1810065E05RikQ5NC41 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
1810065E05RikQ5NC41 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
1810065E05RikQ5NC41 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
1810065E05RikQ5NC41 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
1810065E05RikQ5NC41 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
1810065E05RikQ5NC41 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
1810065E05RikQ5NC41 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
1810065E05RikQ5NC41 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
1810065E05RikQ5NC41 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
1810065E05RikQ5NC41 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
1810065E05RikQ5NC41 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
1810065E05RikQ5NC41 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
1810065E05RikQ5NC41 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
1810065E05RikQ5NC41 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
1810065E05RikQ5NC41 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
1810065E05RikQ5NC41 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
1810065E05RikQ5NC41 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
1810065E05RikQ5NC41 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
1810065E05RikQ5NC41 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
1810065E05RikQ5NC41 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
1810065E05RikQ5NC41 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
1810065E05RikQ5NC41 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
1810065E05RikQ5NC41 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
1810065E05RikQ5NC41 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
1810065E05RikQ5NC41 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
1810065E05RikQ5NC41 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
1810065E05RikQ5NC41 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
1810065E05RikQ5NC41 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
1810065E05RikQ5NC41 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
1810065E05RikQ5NC41 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
1810065E05RikQ5NC41 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
1810065E05RikQ5NC41 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
1810065E05RikQ5NC41 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
1810065E05RikQ5NC41 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
1810065E05RikQ5NC41 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
1810065E05RikQ5NC41 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
1810065E05RikQ5NC41 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
1810065E05RikQ5NC41 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
1810065E05RikQ5NC41 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
1810065E05RikQ5NC41 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
1810065E05RikQ5NC41 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
1810065E05RikQ5NC41 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
1810065E05RikQ5NC41 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
1810065E05RikQ5NC41 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
1810065E05RikQ5NC41 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
1810065E05RikQ5NC41 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
1810065E05RikQ5NC41 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
1810065E05RikQ5NC41 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
1810065E05RikQ5NC41 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
1810065E05RikQ5NC41 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
1810065E05RikQ5NC41 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
1810065E05RikQ5NC41 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
1810065E05RikQ5NC41 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
1810065E05RikQ5NC41 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
1810065E05RikQ5NC41 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
1810065E05RikQ5NC41 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
1810065E05RikQ5NC41 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
1810065E05RikQ5NC41 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
1810065E05RikQ5NC41 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
1810065E05RikQ5NC41 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
1810065E05RikQ5NC41 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
1810065E05RikQ5NC41 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
1810065E05RikQ5NC41 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
1810065E05RikQ5NC41 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
1810065E05RikQ5NC41 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
1810065E05RikQ5NC41 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
1810065E05RikQ5NC41 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
1810065E05RikQ5NC41 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
1810065E05RikQ5NC41 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
1810065E05RikQ5NC41 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
1810065E05RikQ5NC41 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
1810065E05RikQ5NC41 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
1810065E05RikQ5NC41 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
1810065E05RikQ5NC41 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
1810065E05RikQ5NC41 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
1810065E05RikQ5NC41 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
1810065E05RikQ5NC41 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
1810065E05RikQ5NC41 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
1810065E05RikQ5NC41 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
1810065E05RikQ5NC41 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
1810065E05RikQ5NC41 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
1810065E05RikQ5NC41 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
1810065E05RikQ5NC41 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
1810065E05RikQ5NC41 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
1810065E05RikQ5NC41 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
1810065E05RikQ5NC41 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms