Protein–RNA interactions for Protein: Q5GIG6

Tnni3k, Serine/threonine-protein kinase TNNI3K, mousemouse

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Length 834 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni3kQ5GIG6 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tnni3kQ5GIG6 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tnni3kQ5GIG6 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tnni3kQ5GIG6 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tnni3kQ5GIG6 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tnni3kQ5GIG6 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Tnni3kQ5GIG6 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tnni3kQ5GIG6 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Tnni3kQ5GIG6 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Tnni3kQ5GIG6 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tnni3kQ5GIG6 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tnni3kQ5GIG6 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tnni3kQ5GIG6 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tnni3kQ5GIG6 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tnni3kQ5GIG6 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tnni3kQ5GIG6 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tnni3kQ5GIG6 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tnni3kQ5GIG6 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tnni3kQ5GIG6 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Tnni3kQ5GIG6 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Tnni3kQ5GIG6 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Tnni3kQ5GIG6 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tnni3kQ5GIG6 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tnni3kQ5GIG6 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tnni3kQ5GIG6 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tnni3kQ5GIG6 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tnni3kQ5GIG6 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tnni3kQ5GIG6 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tnni3kQ5GIG6 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tnni3kQ5GIG6 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tnni3kQ5GIG6 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tnni3kQ5GIG6 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tnni3kQ5GIG6 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tnni3kQ5GIG6 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tnni3kQ5GIG6 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Tnni3kQ5GIG6 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tnni3kQ5GIG6 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Tnni3kQ5GIG6 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tnni3kQ5GIG6 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Tnni3kQ5GIG6 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tnni3kQ5GIG6 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tnni3kQ5GIG6 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tnni3kQ5GIG6 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tnni3kQ5GIG6 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC19.77■□□□□ 0.75
Tnni3kQ5GIG6 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Tnni3kQ5GIG6 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tnni3kQ5GIG6 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tnni3kQ5GIG6 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tnni3kQ5GIG6 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tnni3kQ5GIG6 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Tnni3kQ5GIG6 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tnni3kQ5GIG6 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tnni3kQ5GIG6 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tnni3kQ5GIG6 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tnni3kQ5GIG6 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tnni3kQ5GIG6 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tnni3kQ5GIG6 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Tnni3kQ5GIG6 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tnni3kQ5GIG6 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tnni3kQ5GIG6 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tnni3kQ5GIG6 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tnni3kQ5GIG6 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tnni3kQ5GIG6 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tnni3kQ5GIG6 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tnni3kQ5GIG6 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tnni3kQ5GIG6 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tnni3kQ5GIG6 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tnni3kQ5GIG6 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tnni3kQ5GIG6 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tnni3kQ5GIG6 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tnni3kQ5GIG6 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tnni3kQ5GIG6 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tnni3kQ5GIG6 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tnni3kQ5GIG6 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tnni3kQ5GIG6 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tnni3kQ5GIG6 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tnni3kQ5GIG6 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Tnni3kQ5GIG6 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tnni3kQ5GIG6 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tnni3kQ5GIG6 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tnni3kQ5GIG6 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tnni3kQ5GIG6 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tnni3kQ5GIG6 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tnni3kQ5GIG6 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tnni3kQ5GIG6 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tnni3kQ5GIG6 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tnni3kQ5GIG6 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tnni3kQ5GIG6 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tnni3kQ5GIG6 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tnni3kQ5GIG6 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tnni3kQ5GIG6 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tnni3kQ5GIG6 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Tnni3kQ5GIG6 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tnni3kQ5GIG6 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tnni3kQ5GIG6 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Tnni3kQ5GIG6 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tnni3kQ5GIG6 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tnni3kQ5GIG6 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tnni3kQ5GIG6 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tnni3kQ5GIG6 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms