Protein–RNA interactions for Protein: Q5FW85

Ecm2, Extracellular matrix protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm2Q5FW85 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Ecm2Q5FW85 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ecm2Q5FW85 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Ecm2Q5FW85 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ecm2Q5FW85 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Ecm2Q5FW85 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Ecm2Q5FW85 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ecm2Q5FW85 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ecm2Q5FW85 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ecm2Q5FW85 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ecm2Q5FW85 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ecm2Q5FW85 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ecm2Q5FW85 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ecm2Q5FW85 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ecm2Q5FW85 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ecm2Q5FW85 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ecm2Q5FW85 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ecm2Q5FW85 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ecm2Q5FW85 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ecm2Q5FW85 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ecm2Q5FW85 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ecm2Q5FW85 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ecm2Q5FW85 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ecm2Q5FW85 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Ecm2Q5FW85 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ecm2Q5FW85 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ecm2Q5FW85 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ecm2Q5FW85 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ecm2Q5FW85 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ecm2Q5FW85 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ecm2Q5FW85 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ecm2Q5FW85 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ecm2Q5FW85 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ecm2Q5FW85 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Ecm2Q5FW85 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ecm2Q5FW85 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ecm2Q5FW85 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ecm2Q5FW85 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ecm2Q5FW85 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ecm2Q5FW85 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ecm2Q5FW85 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ecm2Q5FW85 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Ecm2Q5FW85 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ecm2Q5FW85 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ecm2Q5FW85 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ecm2Q5FW85 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ecm2Q5FW85 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ecm2Q5FW85 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ecm2Q5FW85 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ecm2Q5FW85 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ecm2Q5FW85 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ecm2Q5FW85 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ecm2Q5FW85 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ecm2Q5FW85 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ecm2Q5FW85 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ecm2Q5FW85 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ecm2Q5FW85 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ecm2Q5FW85 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ecm2Q5FW85 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ecm2Q5FW85 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ecm2Q5FW85 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ecm2Q5FW85 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ecm2Q5FW85 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ecm2Q5FW85 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ecm2Q5FW85 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ecm2Q5FW85 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ecm2Q5FW85 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ecm2Q5FW85 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ecm2Q5FW85 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ecm2Q5FW85 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ecm2Q5FW85 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ecm2Q5FW85 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ecm2Q5FW85 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ecm2Q5FW85 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ecm2Q5FW85 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ecm2Q5FW85 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Ecm2Q5FW85 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ecm2Q5FW85 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ecm2Q5FW85 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ecm2Q5FW85 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Ecm2Q5FW85 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ecm2Q5FW85 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ecm2Q5FW85 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ecm2Q5FW85 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ecm2Q5FW85 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ecm2Q5FW85 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ecm2Q5FW85 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ecm2Q5FW85 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Ecm2Q5FW85 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ecm2Q5FW85 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ecm2Q5FW85 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ecm2Q5FW85 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ecm2Q5FW85 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ecm2Q5FW85 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Ecm2Q5FW85 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ecm2Q5FW85 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ecm2Q5FW85 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ecm2Q5FW85 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ecm2Q5FW85 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ecm2Q5FW85 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms