Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU56

Nlrc3, Protein NLRC3, mousemouse

Predictions only

Length 1,064 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc3Q5DU56 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Nlrc3Q5DU56 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nlrc3Q5DU56 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nlrc3Q5DU56 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Nlrc3Q5DU56 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nlrc3Q5DU56 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nlrc3Q5DU56 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nlrc3Q5DU56 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Nlrc3Q5DU56 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nlrc3Q5DU56 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nlrc3Q5DU56 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nlrc3Q5DU56 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nlrc3Q5DU56 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nlrc3Q5DU56 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nlrc3Q5DU56 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nlrc3Q5DU56 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nlrc3Q5DU56 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nlrc3Q5DU56 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nlrc3Q5DU56 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nlrc3Q5DU56 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nlrc3Q5DU56 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nlrc3Q5DU56 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nlrc3Q5DU56 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nlrc3Q5DU56 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nlrc3Q5DU56 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nlrc3Q5DU56 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nlrc3Q5DU56 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nlrc3Q5DU56 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nlrc3Q5DU56 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nlrc3Q5DU56 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nlrc3Q5DU56 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Nlrc3Q5DU56 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nlrc3Q5DU56 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nlrc3Q5DU56 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nlrc3Q5DU56 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nlrc3Q5DU56 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nlrc3Q5DU56 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nlrc3Q5DU56 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nlrc3Q5DU56 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nlrc3Q5DU56 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Nlrc3Q5DU56 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nlrc3Q5DU56 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nlrc3Q5DU56 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nlrc3Q5DU56 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nlrc3Q5DU56 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nlrc3Q5DU56 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nlrc3Q5DU56 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nlrc3Q5DU56 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nlrc3Q5DU56 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nlrc3Q5DU56 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nlrc3Q5DU56 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nlrc3Q5DU56 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nlrc3Q5DU56 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nlrc3Q5DU56 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nlrc3Q5DU56 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nlrc3Q5DU56 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Nlrc3Q5DU56 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nlrc3Q5DU56 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Nlrc3Q5DU56 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nlrc3Q5DU56 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nlrc3Q5DU56 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nlrc3Q5DU56 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
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Nlrc3Q5DU56 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nlrc3Q5DU56 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nlrc3Q5DU56 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nlrc3Q5DU56 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nlrc3Q5DU56 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nlrc3Q5DU56 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nlrc3Q5DU56 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nlrc3Q5DU56 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nlrc3Q5DU56 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nlrc3Q5DU56 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nlrc3Q5DU56 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nlrc3Q5DU56 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nlrc3Q5DU56 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Nlrc3Q5DU56 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nlrc3Q5DU56 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nlrc3Q5DU56 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nlrc3Q5DU56 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nlrc3Q5DU56 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nlrc3Q5DU56 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nlrc3Q5DU56 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nlrc3Q5DU56 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nlrc3Q5DU56 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nlrc3Q5DU56 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Nlrc3Q5DU56 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nlrc3Q5DU56 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nlrc3Q5DU56 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nlrc3Q5DU56 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nlrc3Q5DU56 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nlrc3Q5DU56 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nlrc3Q5DU56 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nlrc3Q5DU56 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nlrc3Q5DU56 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Nlrc3Q5DU56 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nlrc3Q5DU56 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nlrc3Q5DU56 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nlrc3Q5DU56 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nlrc3Q5DU56 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
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