Protein–RNA interactions for Protein: Q569L8

Cenpj, Centromere protein J, mousemouse

Predictions only

Length 1,344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpjQ569L8 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CenpjQ569L8 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CenpjQ569L8 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CenpjQ569L8 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CenpjQ569L8 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CenpjQ569L8 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CenpjQ569L8 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CenpjQ569L8 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CenpjQ569L8 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CenpjQ569L8 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CenpjQ569L8 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CenpjQ569L8 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CenpjQ569L8 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CenpjQ569L8 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CenpjQ569L8 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CenpjQ569L8 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CenpjQ569L8 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CenpjQ569L8 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CenpjQ569L8 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CenpjQ569L8 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CenpjQ569L8 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CenpjQ569L8 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CenpjQ569L8 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CenpjQ569L8 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CenpjQ569L8 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CenpjQ569L8 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CenpjQ569L8 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CenpjQ569L8 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CenpjQ569L8 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CenpjQ569L8 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CenpjQ569L8 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CenpjQ569L8 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CenpjQ569L8 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CenpjQ569L8 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CenpjQ569L8 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CenpjQ569L8 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CenpjQ569L8 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CenpjQ569L8 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CenpjQ569L8 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CenpjQ569L8 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CenpjQ569L8 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CenpjQ569L8 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CenpjQ569L8 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CenpjQ569L8 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CenpjQ569L8 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CenpjQ569L8 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CenpjQ569L8 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CenpjQ569L8 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CenpjQ569L8 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CenpjQ569L8 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CenpjQ569L8 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CenpjQ569L8 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CenpjQ569L8 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CenpjQ569L8 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CenpjQ569L8 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CenpjQ569L8 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CenpjQ569L8 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CenpjQ569L8 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CenpjQ569L8 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CenpjQ569L8 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CenpjQ569L8 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CenpjQ569L8 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CenpjQ569L8 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CenpjQ569L8 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CenpjQ569L8 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CenpjQ569L8 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CenpjQ569L8 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CenpjQ569L8 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CenpjQ569L8 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CenpjQ569L8 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CenpjQ569L8 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CenpjQ569L8 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CenpjQ569L8 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CenpjQ569L8 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CenpjQ569L8 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CenpjQ569L8 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CenpjQ569L8 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CenpjQ569L8 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CenpjQ569L8 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CenpjQ569L8 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CenpjQ569L8 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CenpjQ569L8 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CenpjQ569L8 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CenpjQ569L8 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CenpjQ569L8 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CenpjQ569L8 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CenpjQ569L8 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CenpjQ569L8 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CenpjQ569L8 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CenpjQ569L8 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CenpjQ569L8 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CenpjQ569L8 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CenpjQ569L8 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CenpjQ569L8 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CenpjQ569L8 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CenpjQ569L8 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CenpjQ569L8 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CenpjQ569L8 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CenpjQ569L8 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CenpjQ569L8 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms