Protein–RNA interactions for Protein: Q505G4

Rtl6, Retrotransposon Gag-like protein 6, mousemouse

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Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rtl6Q505G4 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rtl6Q505G4 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rtl6Q505G4 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Rtl6Q505G4 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Rtl6Q505G4 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Rtl6Q505G4 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Rtl6Q505G4 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Rtl6Q505G4 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rtl6Q505G4 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rtl6Q505G4 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rtl6Q505G4 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rtl6Q505G4 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms