Protein–RNA interactions for Protein: Q4VA36

Ccdc84, Coiled-coil domain-containing protein 84, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc84Q4VA36 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc84Q4VA36 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc84Q4VA36 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc84Q4VA36 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc84Q4VA36 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc84Q4VA36 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc84Q4VA36 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc84Q4VA36 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc84Q4VA36 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc84Q4VA36 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc84Q4VA36 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc84Q4VA36 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc84Q4VA36 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc84Q4VA36 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc84Q4VA36 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc84Q4VA36 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc84Q4VA36 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc84Q4VA36 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc84Q4VA36 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc84Q4VA36 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc84Q4VA36 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc84Q4VA36 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc84Q4VA36 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc84Q4VA36 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc84Q4VA36 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc84Q4VA36 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc84Q4VA36 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc84Q4VA36 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc84Q4VA36 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc84Q4VA36 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc84Q4VA36 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc84Q4VA36 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc84Q4VA36 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc84Q4VA36 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc84Q4VA36 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc84Q4VA36 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc84Q4VA36 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc84Q4VA36 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc84Q4VA36 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc84Q4VA36 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc84Q4VA36 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc84Q4VA36 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc84Q4VA36 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc84Q4VA36 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc84Q4VA36 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc84Q4VA36 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc84Q4VA36 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc84Q4VA36 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc84Q4VA36 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc84Q4VA36 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc84Q4VA36 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc84Q4VA36 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc84Q4VA36 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc84Q4VA36 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc84Q4VA36 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc84Q4VA36 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc84Q4VA36 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc84Q4VA36 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc84Q4VA36 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc84Q4VA36 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc84Q4VA36 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc84Q4VA36 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc84Q4VA36 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc84Q4VA36 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc84Q4VA36 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc84Q4VA36 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc84Q4VA36 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc84Q4VA36 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc84Q4VA36 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc84Q4VA36 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc84Q4VA36 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc84Q4VA36 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc84Q4VA36 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc84Q4VA36 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc84Q4VA36 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc84Q4VA36 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc84Q4VA36 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc84Q4VA36 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc84Q4VA36 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc84Q4VA36 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc84Q4VA36 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc84Q4VA36 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc84Q4VA36 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc84Q4VA36 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc84Q4VA36 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc84Q4VA36 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc84Q4VA36 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc84Q4VA36 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc84Q4VA36 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc84Q4VA36 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc84Q4VA36 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc84Q4VA36 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc84Q4VA36 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc84Q4VA36 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc84Q4VA36 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc84Q4VA36 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc84Q4VA36 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc84Q4VA36 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc84Q4VA36 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc84Q4VA36 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms