Protein–RNA interactions for Protein: Q4ACU6

Shank3, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shank3Q4ACU6 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Shank3Q4ACU6 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Shank3Q4ACU6 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Shank3Q4ACU6 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Shank3Q4ACU6 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Shank3Q4ACU6 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Shank3Q4ACU6 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Shank3Q4ACU6 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Shank3Q4ACU6 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Shank3Q4ACU6 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Shank3Q4ACU6 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Shank3Q4ACU6 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Shank3Q4ACU6 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Shank3Q4ACU6 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Shank3Q4ACU6 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Shank3Q4ACU6 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Shank3Q4ACU6 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Shank3Q4ACU6 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Shank3Q4ACU6 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Shank3Q4ACU6 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Shank3Q4ACU6 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Shank3Q4ACU6 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Shank3Q4ACU6 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Shank3Q4ACU6 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Shank3Q4ACU6 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Shank3Q4ACU6 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Shank3Q4ACU6 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Shank3Q4ACU6 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Shank3Q4ACU6 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Shank3Q4ACU6 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Shank3Q4ACU6 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Shank3Q4ACU6 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Shank3Q4ACU6 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Shank3Q4ACU6 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Shank3Q4ACU6 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Shank3Q4ACU6 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Shank3Q4ACU6 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Shank3Q4ACU6 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Shank3Q4ACU6 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Shank3Q4ACU6 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Shank3Q4ACU6 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Shank3Q4ACU6 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Shank3Q4ACU6 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Shank3Q4ACU6 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Shank3Q4ACU6 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Shank3Q4ACU6 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Shank3Q4ACU6 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Shank3Q4ACU6 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Shank3Q4ACU6 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Shank3Q4ACU6 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Shank3Q4ACU6 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Shank3Q4ACU6 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Shank3Q4ACU6 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Shank3Q4ACU6 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Shank3Q4ACU6 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Shank3Q4ACU6 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Shank3Q4ACU6 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Shank3Q4ACU6 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Shank3Q4ACU6 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Shank3Q4ACU6 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Shank3Q4ACU6 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Shank3Q4ACU6 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Shank3Q4ACU6 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Shank3Q4ACU6 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Shank3Q4ACU6 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Shank3Q4ACU6 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Shank3Q4ACU6 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Shank3Q4ACU6 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Shank3Q4ACU6 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Shank3Q4ACU6 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Shank3Q4ACU6 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Shank3Q4ACU6 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Shank3Q4ACU6 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Shank3Q4ACU6 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Shank3Q4ACU6 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Shank3Q4ACU6 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Shank3Q4ACU6 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Shank3Q4ACU6 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Shank3Q4ACU6 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Shank3Q4ACU6 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Shank3Q4ACU6 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Shank3Q4ACU6 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Shank3Q4ACU6 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Shank3Q4ACU6 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Shank3Q4ACU6 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Shank3Q4ACU6 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Shank3Q4ACU6 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Shank3Q4ACU6 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Shank3Q4ACU6 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Shank3Q4ACU6 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Shank3Q4ACU6 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Shank3Q4ACU6 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Shank3Q4ACU6 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Shank3Q4ACU6 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Shank3Q4ACU6 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Shank3Q4ACU6 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Shank3Q4ACU6 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Shank3Q4ACU6 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Shank3Q4ACU6 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Shank3Q4ACU6 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms