Protein–RNA interactions for Protein: Q3V2Q8

N4bp2l1, NEDD4-binding protein 2-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
N4bp2l1Q3V2Q8 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
N4bp2l1Q3V2Q8 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
N4bp2l1Q3V2Q8 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
N4bp2l1Q3V2Q8 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
N4bp2l1Q3V2Q8 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
N4bp2l1Q3V2Q8 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
N4bp2l1Q3V2Q8 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
N4bp2l1Q3V2Q8 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
N4bp2l1Q3V2Q8 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
N4bp2l1Q3V2Q8 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
N4bp2l1Q3V2Q8 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
N4bp2l1Q3V2Q8 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
N4bp2l1Q3V2Q8 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
N4bp2l1Q3V2Q8 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
N4bp2l1Q3V2Q8 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
N4bp2l1Q3V2Q8 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
N4bp2l1Q3V2Q8 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
N4bp2l1Q3V2Q8 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
N4bp2l1Q3V2Q8 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
N4bp2l1Q3V2Q8 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
N4bp2l1Q3V2Q8 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
N4bp2l1Q3V2Q8 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
N4bp2l1Q3V2Q8 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
N4bp2l1Q3V2Q8 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
N4bp2l1Q3V2Q8 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
N4bp2l1Q3V2Q8 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
N4bp2l1Q3V2Q8 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
N4bp2l1Q3V2Q8 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
N4bp2l1Q3V2Q8 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
N4bp2l1Q3V2Q8 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
N4bp2l1Q3V2Q8 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
N4bp2l1Q3V2Q8 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
N4bp2l1Q3V2Q8 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
N4bp2l1Q3V2Q8 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
N4bp2l1Q3V2Q8 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
N4bp2l1Q3V2Q8 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
N4bp2l1Q3V2Q8 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
N4bp2l1Q3V2Q8 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
N4bp2l1Q3V2Q8 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
N4bp2l1Q3V2Q8 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
N4bp2l1Q3V2Q8 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
N4bp2l1Q3V2Q8 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
N4bp2l1Q3V2Q8 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
N4bp2l1Q3V2Q8 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
N4bp2l1Q3V2Q8 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
N4bp2l1Q3V2Q8 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
N4bp2l1Q3V2Q8 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
N4bp2l1Q3V2Q8 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
N4bp2l1Q3V2Q8 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
N4bp2l1Q3V2Q8 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
N4bp2l1Q3V2Q8 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
N4bp2l1Q3V2Q8 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
N4bp2l1Q3V2Q8 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
N4bp2l1Q3V2Q8 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
N4bp2l1Q3V2Q8 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
N4bp2l1Q3V2Q8 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
N4bp2l1Q3V2Q8 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
N4bp2l1Q3V2Q8 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
N4bp2l1Q3V2Q8 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
N4bp2l1Q3V2Q8 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
N4bp2l1Q3V2Q8 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
N4bp2l1Q3V2Q8 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
N4bp2l1Q3V2Q8 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
N4bp2l1Q3V2Q8 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
N4bp2l1Q3V2Q8 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
N4bp2l1Q3V2Q8 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
N4bp2l1Q3V2Q8 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
N4bp2l1Q3V2Q8 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
N4bp2l1Q3V2Q8 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
N4bp2l1Q3V2Q8 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
N4bp2l1Q3V2Q8 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
N4bp2l1Q3V2Q8 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
N4bp2l1Q3V2Q8 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
N4bp2l1Q3V2Q8 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
N4bp2l1Q3V2Q8 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
N4bp2l1Q3V2Q8 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
N4bp2l1Q3V2Q8 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
N4bp2l1Q3V2Q8 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
N4bp2l1Q3V2Q8 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
N4bp2l1Q3V2Q8 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
N4bp2l1Q3V2Q8 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
N4bp2l1Q3V2Q8 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
N4bp2l1Q3V2Q8 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
N4bp2l1Q3V2Q8 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
N4bp2l1Q3V2Q8 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
N4bp2l1Q3V2Q8 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
N4bp2l1Q3V2Q8 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
N4bp2l1Q3V2Q8 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
N4bp2l1Q3V2Q8 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
N4bp2l1Q3V2Q8 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
N4bp2l1Q3V2Q8 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
N4bp2l1Q3V2Q8 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
N4bp2l1Q3V2Q8 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
N4bp2l1Q3V2Q8 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
N4bp2l1Q3V2Q8 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
N4bp2l1Q3V2Q8 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
N4bp2l1Q3V2Q8 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
N4bp2l1Q3V2Q8 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
N4bp2l1Q3V2Q8 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
N4bp2l1Q3V2Q8 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms