Protein–RNA interactions for Protein: Q3V2J1

6430531B16Rik, RIKEN cDNA 6430531B16 gene, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6430531B16RikQ3V2J1 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
6430531B16RikQ3V2J1 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
6430531B16RikQ3V2J1 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
6430531B16RikQ3V2J1 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
6430531B16RikQ3V2J1 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
6430531B16RikQ3V2J1 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
6430531B16RikQ3V2J1 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
6430531B16RikQ3V2J1 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
6430531B16RikQ3V2J1 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
6430531B16RikQ3V2J1 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
6430531B16RikQ3V2J1 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
6430531B16RikQ3V2J1 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
6430531B16RikQ3V2J1 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
6430531B16RikQ3V2J1 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
6430531B16RikQ3V2J1 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
6430531B16RikQ3V2J1 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
6430531B16RikQ3V2J1 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
6430531B16RikQ3V2J1 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
6430531B16RikQ3V2J1 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
6430531B16RikQ3V2J1 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
6430531B16RikQ3V2J1 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
6430531B16RikQ3V2J1 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
6430531B16RikQ3V2J1 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
6430531B16RikQ3V2J1 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
6430531B16RikQ3V2J1 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
6430531B16RikQ3V2J1 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
6430531B16RikQ3V2J1 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
6430531B16RikQ3V2J1 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
6430531B16RikQ3V2J1 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
6430531B16RikQ3V2J1 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
6430531B16RikQ3V2J1 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
6430531B16RikQ3V2J1 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
6430531B16RikQ3V2J1 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
6430531B16RikQ3V2J1 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
6430531B16RikQ3V2J1 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
6430531B16RikQ3V2J1 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
6430531B16RikQ3V2J1 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
6430531B16RikQ3V2J1 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
6430531B16RikQ3V2J1 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
6430531B16RikQ3V2J1 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
6430531B16RikQ3V2J1 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
6430531B16RikQ3V2J1 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
6430531B16RikQ3V2J1 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
6430531B16RikQ3V2J1 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
6430531B16RikQ3V2J1 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
6430531B16RikQ3V2J1 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
6430531B16RikQ3V2J1 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
6430531B16RikQ3V2J1 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
6430531B16RikQ3V2J1 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
6430531B16RikQ3V2J1 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
6430531B16RikQ3V2J1 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
6430531B16RikQ3V2J1 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
6430531B16RikQ3V2J1 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
6430531B16RikQ3V2J1 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
6430531B16RikQ3V2J1 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
6430531B16RikQ3V2J1 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
6430531B16RikQ3V2J1 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
6430531B16RikQ3V2J1 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
6430531B16RikQ3V2J1 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
6430531B16RikQ3V2J1 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
6430531B16RikQ3V2J1 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
6430531B16RikQ3V2J1 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
6430531B16RikQ3V2J1 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
6430531B16RikQ3V2J1 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
6430531B16RikQ3V2J1 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
6430531B16RikQ3V2J1 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
6430531B16RikQ3V2J1 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
6430531B16RikQ3V2J1 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
6430531B16RikQ3V2J1 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
6430531B16RikQ3V2J1 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
6430531B16RikQ3V2J1 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
6430531B16RikQ3V2J1 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
6430531B16RikQ3V2J1 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
6430531B16RikQ3V2J1 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
6430531B16RikQ3V2J1 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
6430531B16RikQ3V2J1 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
6430531B16RikQ3V2J1 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
6430531B16RikQ3V2J1 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
6430531B16RikQ3V2J1 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
6430531B16RikQ3V2J1 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
6430531B16RikQ3V2J1 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
6430531B16RikQ3V2J1 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
6430531B16RikQ3V2J1 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
6430531B16RikQ3V2J1 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
6430531B16RikQ3V2J1 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
6430531B16RikQ3V2J1 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
6430531B16RikQ3V2J1 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
6430531B16RikQ3V2J1 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
6430531B16RikQ3V2J1 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
6430531B16RikQ3V2J1 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
6430531B16RikQ3V2J1 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
6430531B16RikQ3V2J1 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
6430531B16RikQ3V2J1 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
6430531B16RikQ3V2J1 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
6430531B16RikQ3V2J1 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
6430531B16RikQ3V2J1 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
6430531B16RikQ3V2J1 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
6430531B16RikQ3V2J1 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
6430531B16RikQ3V2J1 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
6430531B16RikQ3V2J1 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 639.3 ms