Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1L6

Mtmr11, Myotubularin-related protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtmr11Q3V1L6 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mtmr11Q3V1L6 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mtmr11Q3V1L6 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mtmr11Q3V1L6 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mtmr11Q3V1L6 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mtmr11Q3V1L6 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mtmr11Q3V1L6 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mtmr11Q3V1L6 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mtmr11Q3V1L6 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mtmr11Q3V1L6 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mtmr11Q3V1L6 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mtmr11Q3V1L6 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mtmr11Q3V1L6 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mtmr11Q3V1L6 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mtmr11Q3V1L6 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mtmr11Q3V1L6 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mtmr11Q3V1L6 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mtmr11Q3V1L6 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mtmr11Q3V1L6 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mtmr11Q3V1L6 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mtmr11Q3V1L6 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mtmr11Q3V1L6 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mtmr11Q3V1L6 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mtmr11Q3V1L6 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mtmr11Q3V1L6 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mtmr11Q3V1L6 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mtmr11Q3V1L6 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mtmr11Q3V1L6 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mtmr11Q3V1L6 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mtmr11Q3V1L6 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mtmr11Q3V1L6 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mtmr11Q3V1L6 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mtmr11Q3V1L6 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mtmr11Q3V1L6 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mtmr11Q3V1L6 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mtmr11Q3V1L6 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mtmr11Q3V1L6 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mtmr11Q3V1L6 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mtmr11Q3V1L6 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mtmr11Q3V1L6 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mtmr11Q3V1L6 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mtmr11Q3V1L6 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mtmr11Q3V1L6 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Mtmr11Q3V1L6 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Mtmr11Q3V1L6 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mtmr11Q3V1L6 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mtmr11Q3V1L6 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mtmr11Q3V1L6 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mtmr11Q3V1L6 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mtmr11Q3V1L6 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mtmr11Q3V1L6 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mtmr11Q3V1L6 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mtmr11Q3V1L6 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mtmr11Q3V1L6 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mtmr11Q3V1L6 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mtmr11Q3V1L6 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mtmr11Q3V1L6 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mtmr11Q3V1L6 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mtmr11Q3V1L6 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mtmr11Q3V1L6 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mtmr11Q3V1L6 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mtmr11Q3V1L6 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mtmr11Q3V1L6 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mtmr11Q3V1L6 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mtmr11Q3V1L6 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mtmr11Q3V1L6 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mtmr11Q3V1L6 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Mtmr11Q3V1L6 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mtmr11Q3V1L6 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mtmr11Q3V1L6 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mtmr11Q3V1L6 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mtmr11Q3V1L6 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mtmr11Q3V1L6 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mtmr11Q3V1L6 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mtmr11Q3V1L6 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mtmr11Q3V1L6 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mtmr11Q3V1L6 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mtmr11Q3V1L6 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mtmr11Q3V1L6 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mtmr11Q3V1L6 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mtmr11Q3V1L6 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mtmr11Q3V1L6 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mtmr11Q3V1L6 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mtmr11Q3V1L6 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mtmr11Q3V1L6 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mtmr11Q3V1L6 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mtmr11Q3V1L6 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mtmr11Q3V1L6 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mtmr11Q3V1L6 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mtmr11Q3V1L6 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mtmr11Q3V1L6 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mtmr11Q3V1L6 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Mtmr11Q3V1L6 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mtmr11Q3V1L6 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mtmr11Q3V1L6 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mtmr11Q3V1L6 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mtmr11Q3V1L6 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mtmr11Q3V1L6 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Mtmr11Q3V1L6 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mtmr11Q3V1L6 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms