Protein–RNA interactions for Protein: Q3V129

Ulk4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, mousemouse

Predictions only

Length 1,303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk4Q3V129 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ulk4Q3V129 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ulk4Q3V129 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ulk4Q3V129 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ulk4Q3V129 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ulk4Q3V129 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ulk4Q3V129 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ulk4Q3V129 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ulk4Q3V129 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ulk4Q3V129 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ulk4Q3V129 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ulk4Q3V129 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ulk4Q3V129 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ulk4Q3V129 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ulk4Q3V129 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ulk4Q3V129 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ulk4Q3V129 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ulk4Q3V129 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ulk4Q3V129 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ulk4Q3V129 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ulk4Q3V129 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ulk4Q3V129 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ulk4Q3V129 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ulk4Q3V129 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ulk4Q3V129 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ulk4Q3V129 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ulk4Q3V129 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ulk4Q3V129 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ulk4Q3V129 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ulk4Q3V129 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Ulk4Q3V129 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ulk4Q3V129 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ulk4Q3V129 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ulk4Q3V129 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ulk4Q3V129 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ulk4Q3V129 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ulk4Q3V129 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ulk4Q3V129 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Ulk4Q3V129 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ulk4Q3V129 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ulk4Q3V129 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ulk4Q3V129 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ulk4Q3V129 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Ulk4Q3V129 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ulk4Q3V129 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ulk4Q3V129 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ulk4Q3V129 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ulk4Q3V129 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Ulk4Q3V129 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ulk4Q3V129 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ulk4Q3V129 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ulk4Q3V129 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ulk4Q3V129 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ulk4Q3V129 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ulk4Q3V129 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ulk4Q3V129 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ulk4Q3V129 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ulk4Q3V129 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ulk4Q3V129 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ulk4Q3V129 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ulk4Q3V129 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ulk4Q3V129 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Ulk4Q3V129 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ulk4Q3V129 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ulk4Q3V129 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ulk4Q3V129 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ulk4Q3V129 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ulk4Q3V129 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ulk4Q3V129 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ulk4Q3V129 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ulk4Q3V129 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Ulk4Q3V129 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ulk4Q3V129 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ulk4Q3V129 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ulk4Q3V129 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ulk4Q3V129 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ulk4Q3V129 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ulk4Q3V129 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ulk4Q3V129 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ulk4Q3V129 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Ulk4Q3V129 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ulk4Q3V129 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ulk4Q3V129 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ulk4Q3V129 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ulk4Q3V129 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ulk4Q3V129 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ulk4Q3V129 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ulk4Q3V129 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ulk4Q3V129 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ulk4Q3V129 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ulk4Q3V129 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ulk4Q3V129 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ulk4Q3V129 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ulk4Q3V129 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ulk4Q3V129 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ulk4Q3V129 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ulk4Q3V129 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ulk4Q3V129 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ulk4Q3V129 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ulk4Q3V129 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms