Protein–RNA interactions for Protein: Q3V118

Ccdc185, Coiled-coil domain-containing 185, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc185Q3V118 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc185Q3V118 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc185Q3V118 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc185Q3V118 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc185Q3V118 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc185Q3V118 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc185Q3V118 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc185Q3V118 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc185Q3V118 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc185Q3V118 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc185Q3V118 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc185Q3V118 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc185Q3V118 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc185Q3V118 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc185Q3V118 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc185Q3V118 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc185Q3V118 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc185Q3V118 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc185Q3V118 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc185Q3V118 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc185Q3V118 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc185Q3V118 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc185Q3V118 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc185Q3V118 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc185Q3V118 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc185Q3V118 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc185Q3V118 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc185Q3V118 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc185Q3V118 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc185Q3V118 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc185Q3V118 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc185Q3V118 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc185Q3V118 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc185Q3V118 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc185Q3V118 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc185Q3V118 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc185Q3V118 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc185Q3V118 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc185Q3V118 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc185Q3V118 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc185Q3V118 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc185Q3V118 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc185Q3V118 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc185Q3V118 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc185Q3V118 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc185Q3V118 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc185Q3V118 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc185Q3V118 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc185Q3V118 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc185Q3V118 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc185Q3V118 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc185Q3V118 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc185Q3V118 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc185Q3V118 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc185Q3V118 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc185Q3V118 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc185Q3V118 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc185Q3V118 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc185Q3V118 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc185Q3V118 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc185Q3V118 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc185Q3V118 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc185Q3V118 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc185Q3V118 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc185Q3V118 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc185Q3V118 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc185Q3V118 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc185Q3V118 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc185Q3V118 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc185Q3V118 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc185Q3V118 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc185Q3V118 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc185Q3V118 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc185Q3V118 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc185Q3V118 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc185Q3V118 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc185Q3V118 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc185Q3V118 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc185Q3V118 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc185Q3V118 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc185Q3V118 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc185Q3V118 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc185Q3V118 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc185Q3V118 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc185Q3V118 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc185Q3V118 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc185Q3V118 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc185Q3V118 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc185Q3V118 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc185Q3V118 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc185Q3V118 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc185Q3V118 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc185Q3V118 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc185Q3V118 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc185Q3V118 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc185Q3V118 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc185Q3V118 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc185Q3V118 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc185Q3V118 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc185Q3V118 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms