Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0F0

Rimbp3, RIMS-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rimbp3Q3V0F0 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Rimbp3Q3V0F0 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rimbp3Q3V0F0 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rimbp3Q3V0F0 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rimbp3Q3V0F0 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rimbp3Q3V0F0 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rimbp3Q3V0F0 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rimbp3Q3V0F0 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rimbp3Q3V0F0 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rimbp3Q3V0F0 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rimbp3Q3V0F0 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rimbp3Q3V0F0 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Rimbp3Q3V0F0 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rimbp3Q3V0F0 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rimbp3Q3V0F0 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rimbp3Q3V0F0 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rimbp3Q3V0F0 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rimbp3Q3V0F0 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rimbp3Q3V0F0 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rimbp3Q3V0F0 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rimbp3Q3V0F0 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rimbp3Q3V0F0 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Rimbp3Q3V0F0 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rimbp3Q3V0F0 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rimbp3Q3V0F0 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Rimbp3Q3V0F0 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rimbp3Q3V0F0 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rimbp3Q3V0F0 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rimbp3Q3V0F0 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rimbp3Q3V0F0 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rimbp3Q3V0F0 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rimbp3Q3V0F0 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Rimbp3Q3V0F0 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rimbp3Q3V0F0 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rimbp3Q3V0F0 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rimbp3Q3V0F0 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rimbp3Q3V0F0 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rimbp3Q3V0F0 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rimbp3Q3V0F0 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rimbp3Q3V0F0 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rimbp3Q3V0F0 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Rimbp3Q3V0F0 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Rimbp3Q3V0F0 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Rimbp3Q3V0F0 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Rimbp3Q3V0F0 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rimbp3Q3V0F0 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Rimbp3Q3V0F0 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rimbp3Q3V0F0 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rimbp3Q3V0F0 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rimbp3Q3V0F0 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rimbp3Q3V0F0 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rimbp3Q3V0F0 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rimbp3Q3V0F0 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rimbp3Q3V0F0 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rimbp3Q3V0F0 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rimbp3Q3V0F0 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rimbp3Q3V0F0 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rimbp3Q3V0F0 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rimbp3Q3V0F0 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rimbp3Q3V0F0 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rimbp3Q3V0F0 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rimbp3Q3V0F0 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rimbp3Q3V0F0 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rimbp3Q3V0F0 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rimbp3Q3V0F0 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Rimbp3Q3V0F0 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Rimbp3Q3V0F0 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Rimbp3Q3V0F0 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rimbp3Q3V0F0 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rimbp3Q3V0F0 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rimbp3Q3V0F0 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rimbp3Q3V0F0 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rimbp3Q3V0F0 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Rimbp3Q3V0F0 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rimbp3Q3V0F0 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rimbp3Q3V0F0 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rimbp3Q3V0F0 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rimbp3Q3V0F0 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rimbp3Q3V0F0 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rimbp3Q3V0F0 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rimbp3Q3V0F0 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rimbp3Q3V0F0 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rimbp3Q3V0F0 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rimbp3Q3V0F0 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rimbp3Q3V0F0 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rimbp3Q3V0F0 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rimbp3Q3V0F0 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rimbp3Q3V0F0 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rimbp3Q3V0F0 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rimbp3Q3V0F0 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rimbp3Q3V0F0 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rimbp3Q3V0F0 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rimbp3Q3V0F0 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rimbp3Q3V0F0 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rimbp3Q3V0F0 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rimbp3Q3V0F0 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rimbp3Q3V0F0 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rimbp3Q3V0F0 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rimbp3Q3V0F0 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rimbp3Q3V0F0 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms