Protein–RNA interactions for Protein: Q3V036

Ccdc27, Coiled-coil domain-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc27Q3V036 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc27Q3V036 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc27Q3V036 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc27Q3V036 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc27Q3V036 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc27Q3V036 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc27Q3V036 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc27Q3V036 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc27Q3V036 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc27Q3V036 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc27Q3V036 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc27Q3V036 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc27Q3V036 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc27Q3V036 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc27Q3V036 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc27Q3V036 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc27Q3V036 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc27Q3V036 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc27Q3V036 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc27Q3V036 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc27Q3V036 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc27Q3V036 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc27Q3V036 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc27Q3V036 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc27Q3V036 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc27Q3V036 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc27Q3V036 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc27Q3V036 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc27Q3V036 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc27Q3V036 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc27Q3V036 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc27Q3V036 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc27Q3V036 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc27Q3V036 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc27Q3V036 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc27Q3V036 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc27Q3V036 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc27Q3V036 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc27Q3V036 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc27Q3V036 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc27Q3V036 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc27Q3V036 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc27Q3V036 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc27Q3V036 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc27Q3V036 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc27Q3V036 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc27Q3V036 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc27Q3V036 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc27Q3V036 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc27Q3V036 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc27Q3V036 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc27Q3V036 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc27Q3V036 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc27Q3V036 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc27Q3V036 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc27Q3V036 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc27Q3V036 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc27Q3V036 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc27Q3V036 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc27Q3V036 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc27Q3V036 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc27Q3V036 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc27Q3V036 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc27Q3V036 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc27Q3V036 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc27Q3V036 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc27Q3V036 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc27Q3V036 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc27Q3V036 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc27Q3V036 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc27Q3V036 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc27Q3V036 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc27Q3V036 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc27Q3V036 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc27Q3V036 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc27Q3V036 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc27Q3V036 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc27Q3V036 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc27Q3V036 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc27Q3V036 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc27Q3V036 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc27Q3V036 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc27Q3V036 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc27Q3V036 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc27Q3V036 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc27Q3V036 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc27Q3V036 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc27Q3V036 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc27Q3V036 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc27Q3V036 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc27Q3V036 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc27Q3V036 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc27Q3V036 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc27Q3V036 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc27Q3V036 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc27Q3V036 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc27Q3V036 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc27Q3V036 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc27Q3V036 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc27Q3V036 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.5 ms