Protein–RNA interactions for Protein: Q3UUV9

H2-Eb2, Histocompatibility 2, class II antigen E beta2, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb2Q3UUV9 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
H2-Eb2Q3UUV9 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2-Eb2Q3UUV9 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2-Eb2Q3UUV9 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2-Eb2Q3UUV9 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2-Eb2Q3UUV9 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2-Eb2Q3UUV9 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2-Eb2Q3UUV9 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2-Eb2Q3UUV9 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
H2-Eb2Q3UUV9 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2-Eb2Q3UUV9 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2-Eb2Q3UUV9 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2-Eb2Q3UUV9 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2-Eb2Q3UUV9 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2-Eb2Q3UUV9 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2-Eb2Q3UUV9 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2-Eb2Q3UUV9 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2-Eb2Q3UUV9 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2-Eb2Q3UUV9 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2-Eb2Q3UUV9 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2-Eb2Q3UUV9 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2-Eb2Q3UUV9 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2-Eb2Q3UUV9 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2-Eb2Q3UUV9 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2-Eb2Q3UUV9 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2-Eb2Q3UUV9 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-Eb2Q3UUV9 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-Eb2Q3UUV9 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-Eb2Q3UUV9 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-Eb2Q3UUV9 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-Eb2Q3UUV9 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-Eb2Q3UUV9 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-Eb2Q3UUV9 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-Eb2Q3UUV9 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-Eb2Q3UUV9 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-Eb2Q3UUV9 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-Eb2Q3UUV9 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-Eb2Q3UUV9 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-Eb2Q3UUV9 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-Eb2Q3UUV9 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-Eb2Q3UUV9 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-Eb2Q3UUV9 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-Eb2Q3UUV9 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-Eb2Q3UUV9 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-Eb2Q3UUV9 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-Eb2Q3UUV9 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-Eb2Q3UUV9 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-Eb2Q3UUV9 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-Eb2Q3UUV9 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-Eb2Q3UUV9 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-Eb2Q3UUV9 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-Eb2Q3UUV9 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-Eb2Q3UUV9 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-Eb2Q3UUV9 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-Eb2Q3UUV9 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-Eb2Q3UUV9 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-Eb2Q3UUV9 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-Eb2Q3UUV9 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-Eb2Q3UUV9 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-Eb2Q3UUV9 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-Eb2Q3UUV9 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
H2-Eb2Q3UUV9 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
H2-Eb2Q3UUV9 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
H2-Eb2Q3UUV9 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
H2-Eb2Q3UUV9 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
H2-Eb2Q3UUV9 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2-Eb2Q3UUV9 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2-Eb2Q3UUV9 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2-Eb2Q3UUV9 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
H2-Eb2Q3UUV9 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
H2-Eb2Q3UUV9 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2-Eb2Q3UUV9 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2-Eb2Q3UUV9 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
H2-Eb2Q3UUV9 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2-Eb2Q3UUV9 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2-Eb2Q3UUV9 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2-Eb2Q3UUV9 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2-Eb2Q3UUV9 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2-Eb2Q3UUV9 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2-Eb2Q3UUV9 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
H2-Eb2Q3UUV9 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2-Eb2Q3UUV9 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2-Eb2Q3UUV9 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2-Eb2Q3UUV9 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2-Eb2Q3UUV9 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2-Eb2Q3UUV9 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-Eb2Q3UUV9 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-Eb2Q3UUV9 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-Eb2Q3UUV9 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-Eb2Q3UUV9 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-Eb2Q3UUV9 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-Eb2Q3UUV9 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-Eb2Q3UUV9 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-Eb2Q3UUV9 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-Eb2Q3UUV9 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-Eb2Q3UUV9 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-Eb2Q3UUV9 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-Eb2Q3UUV9 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-Eb2Q3UUV9 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-Eb2Q3UUV9 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms