Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU43

Chpf2, Hexosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chpf2Q3UU43 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chpf2Q3UU43 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Chpf2Q3UU43 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Chpf2Q3UU43 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chpf2Q3UU43 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chpf2Q3UU43 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Chpf2Q3UU43 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Chpf2Q3UU43 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Chpf2Q3UU43 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Chpf2Q3UU43 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Chpf2Q3UU43 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Chpf2Q3UU43 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Chpf2Q3UU43 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Chpf2Q3UU43 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chpf2Q3UU43 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chpf2Q3UU43 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chpf2Q3UU43 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chpf2Q3UU43 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chpf2Q3UU43 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chpf2Q3UU43 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chpf2Q3UU43 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Chpf2Q3UU43 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chpf2Q3UU43 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chpf2Q3UU43 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chpf2Q3UU43 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chpf2Q3UU43 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chpf2Q3UU43 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chpf2Q3UU43 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chpf2Q3UU43 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chpf2Q3UU43 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chpf2Q3UU43 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chpf2Q3UU43 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chpf2Q3UU43 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Chpf2Q3UU43 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chpf2Q3UU43 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chpf2Q3UU43 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chpf2Q3UU43 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chpf2Q3UU43 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chpf2Q3UU43 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chpf2Q3UU43 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chpf2Q3UU43 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chpf2Q3UU43 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chpf2Q3UU43 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chpf2Q3UU43 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chpf2Q3UU43 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chpf2Q3UU43 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chpf2Q3UU43 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chpf2Q3UU43 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chpf2Q3UU43 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chpf2Q3UU43 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chpf2Q3UU43 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chpf2Q3UU43 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Chpf2Q3UU43 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Chpf2Q3UU43 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Chpf2Q3UU43 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Chpf2Q3UU43 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Chpf2Q3UU43 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Chpf2Q3UU43 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Chpf2Q3UU43 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Chpf2Q3UU43 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Chpf2Q3UU43 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Chpf2Q3UU43 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Chpf2Q3UU43 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Chpf2Q3UU43 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chpf2Q3UU43 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chpf2Q3UU43 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chpf2Q3UU43 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chpf2Q3UU43 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chpf2Q3UU43 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chpf2Q3UU43 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chpf2Q3UU43 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chpf2Q3UU43 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chpf2Q3UU43 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chpf2Q3UU43 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chpf2Q3UU43 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Chpf2Q3UU43 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chpf2Q3UU43 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chpf2Q3UU43 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chpf2Q3UU43 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Chpf2Q3UU43 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Chpf2Q3UU43 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Chpf2Q3UU43 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Chpf2Q3UU43 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Chpf2Q3UU43 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Chpf2Q3UU43 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Chpf2Q3UU43 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Chpf2Q3UU43 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Chpf2Q3UU43 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Chpf2Q3UU43 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Chpf2Q3UU43 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Chpf2Q3UU43 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Chpf2Q3UU43 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Chpf2Q3UU43 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Chpf2Q3UU43 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Chpf2Q3UU43 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Chpf2Q3UU43 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Chpf2Q3UU43 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Chpf2Q3UU43 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Chpf2Q3UU43 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Chpf2Q3UU43 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms